HPV6 E1

Accession: H002799

Protein: E1

Organism: Human papillomavirus type 6

Function

ATP-dependent DNA helicase required for initiation of viral DNA replication. It forms a complex with the viral E2 protein.

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PPV_E1_C	1463-2752	1290	Papillomavirus helicase; This protein is a DNA helicase that is required for initiation of viral DNA replication. This protein forms a complex with the E2 protein pfam00508.
CDD	PPV_E1_N	833-1261	429	E1 Protein, N terminal domain;
CDD	Parvo_NS1	2153-2548	396	Parvovirus non-structural protein NS1; This family also contains the NS2 protein.
CDD	PHA02774	833-2779	1947	E1; Provisional
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MOTIF_SCAN		2687-2698	12
MOTIF_SCAN		2708-2719	12
MOTIF_SCAN		863-880	18
MOTIF_SCAN		917-934	18
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MOTIF_SCAN		1463-2752	1290
MOTIF_SCAN		833-1261	429
MOTIF_SCAN		1889-2704	816
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INTERPROSCAN		2186-2638	453
INTERPROSCAN		2087-2698	612
INTERPROSCAN		833-1252	420
INTERPROSCAN		2072-2704	633
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MOTIF_SEAR_IN_PROT		1463-2752	1290
MOTIF_SEAR_IN_PROT		833-1261	429
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MOTIF_SEAR_IN_PROT		1463-2752	1290
MOTIF_SEAR_IN_PROT		833-1252	420
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2153-2551	399
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2228-2302	75
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TMPRED_SERVER		1772-1828	57
TMPRED_SERVER		1790-1840	51
TMPRED_SERVER		2288-2338	51
TMPRED_SERVER		2291-2347	57

Sequence

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atggcggacgattcaggtacagaaaatgaggggtctgggtgtacaggatggtttatggta　　　　　C:60
 M  A  D  D  S  G  T  E  N  E  G  S  G  C  T  G  W  F  M  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:952
gaagctatagtgcaacacccaacaggtacacaaatatcagacgatgaggatgaggaggtg　　　　　C:60
 E  A  I  V  Q  H  P  T  G  T  Q  I  S  D  D  E  D  E  E  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1012
gaggacagtgggtatgacatggtggactttattgatgacagcaatattacacacaattcc　　　　　C:60
 E  D  S  G  Y  D  M  V  D  F  I  D  D  S  N  I  T  H  N  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1072
ttggaagcacaggcattgtttaacaggcaggaggcggacacccattatgcgactgtgcag　　　　　C:60
 L  E  A  Q  A  L  F  N  R  Q  E  A  D  T  H  Y  A  T  V  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1132
gacctaaaacgaaagtatttaggtagtccatatgttagtcctataaacactatagccgag　　　　　C:60
 D  L  K  R  K  Y  L  G  S  P  Y  V  S  P  I  N  T  I  A  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1192
gcagtggaaagtgaaataagtccacgattggacgccattaaacttacaagacagccaaaa　　　　　C:60
 A  V  E  S  E  I  S  P  R  L  D  A  I  K  L  T  R  Q  P  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1252
aaggtaaagcgacggctgtttcaaaccagggaactaacggacagtggatatggctattct　　　　　C:60
 K  V  K  R  R  L  F  Q  T  R  E  L  T  D  S  G  Y  G  Y  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1312
gaagtggaagctggaacgggaacgcaggtagagaaacatggcgtaccggaaaatggggga　　　　　C:60
 E  V  E  A  G  T  G  T  Q  V  E  K  H  G  V  P  E  N  G  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1372
gatggtcaggaaaaggacacaggaagggacatagagggggaggaacatacagaggcggaa　　　　　C:60
 D  G  Q  E  K  D  T  G  R  D  I  E  G  E  E  H  T  E  A  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1432
gcgcccacaaacagtgtacgggagcatgcaggcacagcaggaatattggaattgctaaaa　　　　　C:60
 A  P  T  N  S  V  R  E  H  A  G  T  A  G  I  L  E  L  L  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1492
tgtaaagatttacgggcagcattacttggtaagtttaaagaatgctttgggctgtctttt　　　　　C:60
 C  K  D  L  R  A  A  L  L  G  K  F  K  E  C  F  G  L  S  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1552
atagatttaattaggccatttaaaagtgataaaacaacatgtgcagattgggtggtagca　　　　　C:60
 I  D  L  I  R  P  F  K  S  D  K  T  T  C  A  D  W  V  V  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1612
ggatttggtatacatcatagcatatcagaggcatttcaaaaattaattgagccattaagt　　　　　C:60
 G  F  G  I  H  H  S  I  S  E  A  F  Q  K  L  I  E  P  L  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1672
ttatatgcacatatacaatggctaacaaatgcatggggaatggtattgttagtattatta　　　　　C:60
 L  Y  A  H  I  Q  W  L  T  N  A  W  G  M  V  L  L  V  L  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1732
agatttaaagtaaataaaagtagaagtaccgttgcacgtacacttgcaacgctattaaat　　　　　C:60
 R  F  K  V  N  K  S  R  S  T  V  A  R  T  L  A  T  L  L  N 　　　　　P:20


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atacctgaaaatcaaatgttaatagagccaccaaaaatacaaagtggtgttgcagccctg　　　　　C:60
 I  P  E  N  Q  M  L  I  E  P  P  K  I  Q  S  G  V  A  A  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1852
tattggtttcgtacaggtatatcaaatgccagtacagttataggggaagcaccagaatgg　　　　　C:60
 Y  W  F  R  T  G  I  S  N  A  S  T  V  I  G  E  A  P  E  W 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1912
ataacacgccaaactgttattgaacatgggttggcagacagtcagtttaaattaacagaa　　　　　C:60
 I  T  R  Q  T  V  I  E  H  G  L  A  D  S  Q  F  K  L  T  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1972
atggtgcagtgggcatatgataatgacatatgcgaggagagtgaaattgcatttgaatat　　　　　C:60
 M  V  Q  W  A  Y  D  N  D  I  C  E  E  S  E  I  A  F  E  Y 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2032
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 A  Q  R  G  D  F  D  S  N  A  R  A  F  L  N  S  N  M  Q  A 　　　　　P:20


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         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2212
aaaccaattgtacaatttctacgacatcaaaatatagaatttattccatttttaagtaaa　　　　　C:60
 K  P  I  V  Q  F  L  R  H  Q  N  I  E  F  I  P  F  L  S  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2272
tttaaattatggctgcacggtacgccaaaaaaaaactgcatagccatagtaggccctcca　　　　　C:60
 F  K  L  W  L  H  G  T  P  K  K  N  C  I  A  I  V  G  P  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2332
gatactgggaaatcgtacttttgtatgagtttaataagctttttaggaggtacagttatt　　　　　C:60
 D  T  G  K  S  Y  F  C  M  S  L  I  S  F  L  G  G  T  V  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2392
agtcatgtaaattccagcagccatttttggctgcaaccgttagtagatgctaaggtagca　　　　　C:60
 S  H  V  N  S  S  S  H  F  W  L  Q  P  L  V  D  A  K  V  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2452
ttgctagatgatgcaacacagccatgttggatatatatggatacatatatgagaaatttg　　　　　C:60
 L  L  D  D  A  T  Q  P  C  W  I  Y  M  D  T  Y  M  R  N  L 　　　　　P:20


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ttagatggtaatcctatgagtattgacagaaagcataaagcattgacattaattaaatgt　　　　　C:60
 L  D  G  N  P  M  S  I  D  R  K  H  K  A  L  T  L  I  K  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2572
ccacctctgctagtaacatccaacatagatattaccaaagaagagaaatataagtattta　　　　　C:60
 P  P  L  L  V  T  S  N  I  D  I  T  K  E  E  K  Y  K  Y  L 　　　　　P:20


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gcagtgtatgaactgtcaaatgcaaactggaaatgtttttttgaaagactgtcgtcaagc　　　　　C:60
 A  V  Y  E  L  S  N  A  N  W  K  C  F  F  E  R  L  S  S  S 　　　　　P:20


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 L  D  I  Q  D  S  E  D  E  E  D  G  S  N  S  Q  A  F  R  C 　　　　　P:20


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 V  P  G  T  V  V  R  T  L                                  　　　　　P:9

DETAIL

DOMAIN & MUTATION

HPV6 E1

Accession: H002799

Protein: E1

Organism: Human papillomavirus type 6

Function

Domain&Motif

Sequence