HPV6b E6

Accession: H002795

Protein: E6

Organism: Human papillomavirus type 6b

Function

It is an oncogenic protein which causes transformation of host cell by binding to p53 tumour suppressor protein. For binding, it requires E6-associated protein (E6-AP) which is involved in the ubiquitin ligase pathway. E6-AP binds ubiquitin to the p53 pro

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PHA02779	102-551	450	E6 protein; Provisional
CDD	E6	192-521	330	Early Protein (E6);
CDD	PHA02775	135-521	387	E6; Provisional
CDD	CytoC_RC	132-212	81	Cytochrome C subunit of the bacterial photosynthetic reaction center;
MOTIF_SCAN		114-125	12
MOTIF_SCAN		162-173	12
MOTIF_SCAN		489-500	12
MOTIF_SCAN		132-143	12
MOTIF_SCAN		216-227	12
MOTIF_SCAN		360-371	12
MOTIF_SCAN		378-389	12
MOTIF_SCAN		528-539	12
MOTIF_SCAN		495-503	9
MOTIF_SCAN		333-356	24
MOTIF_SCAN		192-521	330
MOTIF_SCAN		192-521	330
INTERPROSCAN		192-521	330
MOTIF_SEAR_IN_PROT		102-551	450
MOTIF_SEAR_IN_PROT		192-521	330
MOTIF_SEAR_IN_PROT		135-521	387
MOTIF_SEAR_IN_PROT		132-212	81
MOTIF_SEAR_IN_PROT		216-416	201
MOTIF_SEAR_IN_PROT		348-464	117
MOTIF_SEAR_IN_PROT		192-521	330
MOTIF_SEAR_IN_PROT		189-248	60
PROSITE_SCAN		114-125	12
PROSITE_SCAN		132-143	12
PROSITE_SCAN		162-173	12
PROSITE_SCAN		216-227	12
PROSITE_SCAN		333-356	24
PROSITE_SCAN		360-371	12
PROSITE_SCAN		378-389	12
PROSITE_SCAN		489-500	12
PROSITE_SCAN		495-503	9
PROSITE_SCAN		528-539	12
SBASE		102-182	81
SBASE		192-521	330
TMPRED_SERVER		186-242	57
TMPRED_SERVER		261-314	54
TMPRED_SERVER		261-320	60
UNIPROTKB		192-302	111
UNIPROTKB		411-521	111

Sequence

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:161
atggaaagtgcaaatgcctccacgtctgcaacgaccatagaccagttgtgcaagacgttt　　　　　C:60
 M  E  S  A  N  A  S  T  S  A  T  T  I  D  Q  L  C  K  T  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:221
aatctatctatgcatacgttgcaaattaattgtgtgttttgcaagaatgcactgaccaca　　　　　C:60
 N  L  S  M  H  T  L  Q  I  N  C  V  F  C  K  N  A  L  T  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:281
gcagagatttattcatatgcatataaacacctaaaggtcctgtttcgaggcggctatcca　　　　　C:60
 A  E  I  Y  S  Y  A  Y  K  H  L  K  V  L  F  R  G  G  Y  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:341
tatgcagcctgcgcgtgctgcctagaatttcatggaaaaataaaccaatatagacacttt　　　　　C:60
 Y  A  A  C  A  C  C  L  E  F  H  G  K  I  N  Q  Y  R  H  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:401
gattatgctggatatgcaacaacagttgaagaagaaactaaacaagacatcttagacgtg　　　　　C:60
 D  Y  A  G  Y  A  T  T  V  E  E  E  T  K  Q  D  I  L  D  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:461
ctaattcggtgctacctgtgtcacaaaccgctgtgtgaagtagaaaaggtaaaacatata　　　　　C:60
 L  I  R  C  Y  L  C  H  K  P  L  C  E  V  E  K  V  K  H  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:521
ctaaccaaggcgcggttcataaagctaaattgtacgtggaagggtcgctgcctacactgc　　　　　C:60
 L  T  K  A  R  F  I  K  L  N  C  T  W  K  G  R  C  L  H  C 　　　　　P:20


         .         .         .                              　　　　　G:554
tggacaacatgcatggaagacatgttaccctaa                           　　　　　C:33
 W  T  T  C  M  E  D  M  L  P                               　　　　　P:10

DETAIL

DOMAIN & MUTATION

HPV6b E6

Accession: H002795

Protein: E6

Organism: Human papillomavirus type 6b

Function

Domain&Motif

Sequence