HPV59 E2

Accession: H001280

Uniprot: Q81967

Protein: E2

Organism: Human papillomavirus type 59

Function

It is responsible for recognition and binding of origin of replication. It exists in two forms such as full length (transcriptional transactivator) and truncated (transcriptional repressor). The ratio of these found in the heterotrimeric complex, formed b

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PPV_E2_N	2751-3353	603	E2 (early) protein, N terminal;
CDD	PPV_E2_C	3609-3842	234	E2 (early) protein, C terminal;
MOTIF_SCAN		3468-3479	12
MOTIF_SCAN		2808-2819	12
MOTIF_SCAN		2979-2990	12
MOTIF_SCAN		3690-3701	12
MOTIF_SCAN		2742-2753	12
MOTIF_SCAN		3351-3362	12
MOTIF_SCAN		3414-3425	12
MOTIF_SCAN		3717-3734	18
MOTIF_SCAN		2760-2768	9
MOTIF_SCAN		2976-2984	9
MOTIF_SCAN		3291-3299	9
MOTIF_SCAN		3468-3476	9
MOTIF_SCAN		3729-3737	9
MOTIF_SCAN		3771-3779	9
MOTIF_SCAN		3795-3803	9
MOTIF_SCAN		2817-2843	27
MOTIF_SCAN		3228-3254	27
MOTIF_SCAN		3258-3284	27
MOTIF_SCAN		3132-3845	714
MOTIF_SCAN		2736-2798	63
MOTIF_SCAN		3609-3842	234
MOTIF_SCAN		2748-2975	228
MOTIF_SCAN		3114-3353	240
MOTIF_SCAN		3609-3842	234
MOTIF_SCAN		2748-3353	606
INTERPROSCAN		2748-2975	228
INTERPROSCAN		3120-3335	216
INTERPROSCAN		3609-3833	225
INTERPROSCAN		3606-3842	237
INTERPROSCAN		3600-3842	243
INTERPROSCAN		2739-2975	237
INTERPROSCAN		3564-3842	279
INTERPROSCAN		3117-3368	252
INTERPROSCAN		3114-3368	255
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2751-3353	603
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3609-3842	234
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3102-3353	252
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2748-2975	228
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3120-3335	216
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3609-3833	225
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3138-3350	213
PROSITE_SCAN		2742-2753	12
PROSITE_SCAN		2760-2768	9
PROSITE_SCAN		2808-2819	12
PROSITE_SCAN		2817-2843	27
PROSITE_SCAN		2976-2984	9
PROSITE_SCAN		2979-2990	12
PROSITE_SCAN		3228-3254	27
PROSITE_SCAN		3258-3284	27
PROSITE_SCAN		3291-3299	9
PROSITE_SCAN		3351-3362	12
PROSITE_SCAN		3414-3425	12
PROSITE_SCAN		3468-3476	9
PROSITE_SCAN		3468-3479	12
PROSITE_SCAN		3690-3701	12
PROSITE_SCAN		3717-3734	18
PROSITE_SCAN		3729-3737	9
PROSITE_SCAN		3771-3779	9
PROSITE_SCAN		3795-3803	9
SBASE		2748-3353	606
SBASE		3426-3587	162
SBASE		3606-3842	237
RADAR		2982-3035	54
RADAR		3048-3092	45
RADAR		3504-3560	57
RADAR		3561-3623	63
RADAR		3147-3176	30
RADAR		3213-3266	54
RADAR		3282-3314	33
TMPRED_SERVER		3054-3110	57
TMPRED_SERVER		3081-3140	60
UNIPROTKB		2748-2975	228
UNIPROTKB		3120-3335	216
UNIPROTKB		3609-3833	225

Sequence

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2795
atgcagacagtgatggacaccctttcgcagcgtttaagtgtgttacaggatcaaatatta　　　　　C:60
 M  Q  T  V  M  D  T  L  S  Q  R  L  S  V  L  Q  D  Q  I  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2855
gaacattatgaaaacgatagtaaagacattaatgaacacataaactattggaaactggtg　　　　　C:60
 E  H  Y  E  N  D  S  K  D  I  N  E  H  I  N  Y  W  K  L  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2915
cgtatggaaaatgtaattttatttgcagcaagagagaacaatatacatacattaaaccac　　　　　C:60
 R  M  E  N  V  I  L  F  A  A  R  E  N  N  I  H  T  L  N  H 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2975
caggtggtgccaacgtttttggtgtctaaaaacaaggcatgtgaagctattgaactgcag　　　　　C:60
 Q  V  V  P  T  F  L  V  S  K  N  K  A  C  E  A  I  E  L  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3035
tcaaaccgtacttccactgtaatgccctgttttttaaaacattttttaggtgctgtttgc　　　　　C:60
 S  N  R  T  S  T  V  M  P  C  F  L  K  H  F  L  G  A  V  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3095
catagttcttggcatgtttcttgcattgtccattgctcatttttaaactcagtttgtgcc　　　　　C:60
 H  S  S  W  H  V  S  C  I  V  H  C  S  F  L  N  S  V  C  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3155
aaactctctaacgccatctgcagcaaggaaaacacaatgcattacacaagctggacattt　　　　　C:60
 K  L  S  N  A  I  C  S  K  E  N  T  M  H  Y  T  S  W  T  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3215
atatattatgtaaatgatgtaggacagtggtgtaaaaccacaggaaatgtggacttttgg　　　　　C:60
 I  Y  Y  V  N  D  V  G  Q  W  C  K  T  T  G  N  V  D  F  W 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3275
ggactatattataaagtggaagaggaacaggtgtactatgtaaaatttatacatgatgcc　　　　　C:60
 G  L  Y  Y  K  V  E  E  E  Q  V  Y  Y  V  K  F  I  H  D  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3335
aaaaaatatgggactacagacaagtgggaagtgcattataatggcaaggttattgattgt　　　　　C:60
 K  K  Y  G  T  T  D  K  W  E  V  H  Y  N  G  K  V  I  D  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3395
tatgactctatgtgcagtaccagtgacgagcaagtatccactgctggatcttctgagcaa　　　　　C:60
 Y  D  S  M  C  S  T  S  D  E  Q  V  S  T  A  G  S  S  E  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3455
ctatcatacccctccgcaacgccccccgaagccacgtacttgggcccccaaacgtggaac　　　　　C:60
 L  S  Y  P  S  A  T  P  P  E  A  T  Y  L  G  P  Q  T  W  N 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3515
cgtcagacgaagactggaaagcgaccaagacagtgtggatacacacagcaccctcagtct　　　　　C:60
 R  Q  T  K  T  G  K  R  P  R  Q  C  G  Y  T  Q  H  P  Q  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3575
accagcgtgtcagtggactactgtgacaacccagtcgtccgtttgcatccaggcaacaac　　　　　C:60
 T  S  V  S  V  D  Y  C  D  N  P  V  V  R  L  H  P  G  N  N 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3635
ccgcgacggcacatcccttgcagtaacactacgcctataatacacttaaaaggtgacaaa　　　　　C:60
 P  R  R  H  I  P  C  S  N  T  T  P  I  I  H  L  K  G  D  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3695
aatggccttaagtgtttaaggtatagattaagaaaagtacactggttatttgaaaatatt　　　　　C:60
 N  G  L  K  C  L  R  Y  R  L  R  K  V  H  W  L  F  E  N  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3755
tcctctacctggcattggacaggaaacagaggatcagccaaaacaggcattttaacatta　　　　　C:60
 S  S  T  W  H  W  T  G  N  R  G  S  A  K  T  G  I  L  T  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3815
acatatacaagcgaaacacaacgcaatgaatttttagatactgtaaaaattcctaatagt　　　　　C:60
 T  Y  T  S  E  T  Q  R  N  E  F  L  D  T  V  K  I  P  N  S 　　　　　P:20


         .         .         .                              　　　　　G:3848
gtacaaatacatgttgggtatatgagtgtgtaa                           　　　　　C:33
 V  Q  I  H  V  G  Y  M  S  V                               　　　　　P:10

DETAIL

DOMAIN & MUTATION