HPV18 L2

Accession: H000141

NC: NP_040316.1

Uniprot: P06793

Protein: L2

Organism: Human papillomavirus type 18

Function

Minor capsid protein. It is required for DNA packaging. It mediates several facets of viral entry including endosomal escape after uncoating.

Mutation

4244-4300

4301-4400

4401-4500

4501-4600

4601-4700

4701-4800

4801-4900

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5601-5632

Legend:same sensemissenseinsertiondeletion

Mutation type	Position	DESC	Disease	Reference
same sense	4580	A → C	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref
missense	4744	T → C (V → A)	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref
missense	4764	G → T (A → S)	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref
same sense	5139	C → A	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref
missense	5350	T → C (F → S)	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref
same sense	5495	G → A	Disease: Condyloma acuminate Region : Heilongjiang	Ref

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Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	Late_protein_L2	4256-5602	1347	Late Protein L2;
CDD	PHA02777	4244-5320	1077	major capsid L1 protein; Provisional
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MOTIF_SCAN		4256-5602	1347
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PROSITE_SCAN		4358-4369	12
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Sequence

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atggtatcccaccgtgccgcacgacgcaaacgggcttcggtaactgacttatataaaaca　　　　　C:60
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tgtaaacaatctggtacatgtccacctgatgttgttcctaaggtggagggcaccacgtta　　　　　C:60
 C  K  Q  S  G  T  C  P  P  D  V  V  P  K  V  E  G  T  T  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4423
gcagataaaatattgcaatggtcaagccttggtatatttttgggtggacttggcataggt　　　　　C:60
 A  D  K  I  L  Q  W  S  S  L  G  I  F  L  G  G  L  G  I  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4483
actggcagtggtacagggggtcgtacagggtacattccattgggtgggcgttccaataca　　　　　C:60
 T  G  S  G  T  G  G  R  T  G  Y  I  P  L  G  G  R  S  N  T 　　　　　P:20


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gtggtggatgttggtcctacacgtcccccagtggttattgaacctgtgggccccacagac　　　　　C:60
 V  V  D  V  G  P  T  R  P  P  V  V  I  E  P  V  G  P  T  D 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4603
ccatctattgttacattaatagaggactccagtgtggttacatcaggtgcacctaggcct　　　　　C:60
 P  S  I  V  T  L  I  E  D  S  S  V  V  T  S  G  A  P  R  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4663
acgtttactggcacgtctgggtttgatataacatctgcgggtacaactacacctgcggtt　　　　　C:60
 T  F  T  G  T  S  G  F  D  I  T  S  A  G  T  T  T  P  A  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4723
ttggatatcacaccttcgtctacctctgtgtctatttccacaaccaattttaccaatcct　　　　　C:60
 L  D  I  T  P  S  S  T  S  V  S  I  S  T  T  N  F  T  N  P 　　　　　P:20


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gcattttctgatccgtccattattgaagttccacaaactggggaggtggcaggtaatgta　　　　　C:60
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         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4843
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 F  V  G  T  P  T  S  G  T  H  G  Y  E  E  I  P  L  Q  T  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4903
gcttcttctggtacgggggaggaacccattagtagtaccccattgcctactgtgcggcgt　　　　　C:60
 A  S  S  G  T  G  E  E  P  I  S  S  T  P  L  P  T  V  R  R 　　　　　P:20


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gtagcaggtccccgcctttacagtagggcctaccaacaagtgtcagtggctaaccctgag　　　　　C:60
 V  A  G  P  R  L  Y  S  R  A  Y  Q  Q  V  S  V  A  N  P  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5023
tttcttacacgtccatcctctttaattacatatgacaacccggcctttgagcctgtggac　　　　　C:60
 F  L  T  R  P  S  S  L  I  T  Y  D  N  P  A  F  E  P  V  D 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5083
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 T  T  L  T  F  D  P  R  S  D  V  P  D  S  D  F  M  D  I  I 　　　　　P:20


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gtctacataggcctgctttaacatccaggcgtgggactgttcgctttagtagattaggtc　　　　　C:60
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 A  T  E  D  N  D  L  F  D  I  Y  A  D  D  M  D  P  A  V  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5383
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 A  P  A  S  T  Q  Y  I  G  I  H  G  T  H  Y  Y  L  W  P  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5623
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 Y  Y  F  I  P  K  K  R  K  R  V  P  Y  F  F  A  D  G  F  V 　　　　　P:20


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 A  A                                                       　　　　　P:2

DETAIL

DOMAIN & MUTATION