HPV52 E2

Accession: H000038

Uniprot: P36796

Protein: E2

Organism: Human papillomavirus type 52

Function

It is responsible for recognition and binding of origin of replication. It exists in two forms such as full length (transcriptional transactivator) and truncated (transcriptional repressor). The ratio of these found in the heterotrimeric complex, formed b

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PPV_E2_N	2746-3330	585	E2 (early) protein, N terminal;
CDD	PPV_E2_C	3607-3843	237	E2 (early) protein, C terminal;
MOTIF_SCAN		2989-3000	12
MOTIF_SCAN		3118-3129	12
MOTIF_SCAN		2848-2859	12
MOTIF_SCAN		3031-3042	12
MOTIF_SCAN		3178-3189	12
MOTIF_SCAN		3340-3351	12
MOTIF_SCAN		3355-3366	12
MOTIF_SCAN		3553-3564	12
MOTIF_SCAN		3712-3723	12
MOTIF_SCAN		3757-3768	12
MOTIF_SCAN		3418-3435	18
MOTIF_SCAN		3544-3561	18
MOTIF_SCAN		3391-3399	9
MOTIF_SCAN		3535-3543	9
MOTIF_SCAN		3568-3576	9
MOTIF_SCAN		3637-3645	9
MOTIF_SCAN		3667-3675	9
MOTIF_SCAN		3772-3780	9
MOTIF_SCAN		3796-3804	9
MOTIF_SCAN		3250-3276	27
MOTIF_SCAN		3064-3846	783
MOTIF_SCAN		3607-3843	237
MOTIF_SCAN		2743-3345	603
MOTIF_SCAN		3607-3843	237
MOTIF_SCAN		2743-3345	603
INTERPROSCAN		3601-3843	243
INTERPROSCAN		3046-3345	300
INTERPROSCAN		3607-3840	234
INTERPROSCAN		3607-3843	237
INTERPROSCAN		3565-3843	279
INTERPROSCAN		2743-3330	588
INTERPROSCAN		2743-3345	603
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2746-3345	600
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3607-3843	237
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2743-3330	588
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3607-3840	234
PROSITE_SCAN		2848-2859	12
PROSITE_SCAN		2989-3000	12
PROSITE_SCAN		3031-3042	12
PROSITE_SCAN		3118-3129	12
PROSITE_SCAN		3178-3189	12
PROSITE_SCAN		3250-3276	27
PROSITE_SCAN		3340-3351	12
PROSITE_SCAN		3355-3366	12
PROSITE_SCAN		3391-3399	9
PROSITE_SCAN		3418-3435	18
PROSITE_SCAN		3535-3543	9
PROSITE_SCAN		3544-3561	18
PROSITE_SCAN		3553-3564	12
PROSITE_SCAN		3568-3576	9
PROSITE_SCAN		3637-3645	9
PROSITE_SCAN		3667-3675	9
PROSITE_SCAN		3712-3723	12
PROSITE_SCAN		3757-3768	12
PROSITE_SCAN		3772-3780	9
PROSITE_SCAN		3796-3804	9
SBASE		2743-3330	588
SBASE		3469-3567	99
SBASE		3607-3843	237
RADAR		3067-3198	132
RADAR		3214-3354	141
RADAR		2836-2904	69
RADAR		3706-3756	51
TMPRED_SERVER		3289-3342	54
TMPRED_SERVER		3307-3357	51
UNIPROTKB		2743-3342	600
UNIPROTKB		3601-3846	246

Sequence

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2802
atggagtcgataccggcacgtttaaatgcagtgcaggaaaaaatactagatctatacgaa　　　　　C:60
 M  E  S  I  P  A  R  L  N  A  V  Q  E  K  I  L  D  L  Y  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2862
gctgatagtaatgacctaaacgcacaaattgaacattggaaattgactcgaatggaatgt　　　　　C:60
 A  D  S  N  D  L  N  A  Q  I  E  H  W  K  L  T  R  M  E  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2922
gttttgttttacaaagcaaaggaactgggaataactcatataggccaccaggtggtgcca　　　　　C:60
 V  L  F  Y  K  A  K  E  L  G  I  T  H  I  G  H  Q  V  V  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2982
ccaatggcagtgtctaaggcaaaggcctgccaagctattgaactacaattggcattggag　　　　　C:60
 P  M  A  V  S  K  A  K  A  C  Q  A  I  E  L  Q  L  A  L  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3042
gcattaaacaaaacacaatatagcacagatggatggacattacaacaaacaagtctagaa　　　　　C:60
 A  L  N  K  T  Q  Y  S  T  D  G  W  T  L  Q  Q  T  S  L  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3102
atgtggcgtgcagaaccacaaaaatactttaaaaaacatgggtatacaataacagtgcaa　　　　　C:60
 M  W  R  A  E  P  Q  K  Y  F  K  K  H  G  Y  T  I  T  V  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3162
tacgataatgataaaaacaatactatggattatacaaactggaaggaaatttatttactt　　　　　C:60
 Y  D  N  D  K  N  N  T  M  D  Y  T  N  W  K  E  I  Y  L  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3222
ggtgagtgtgaatgtacaattgtagaaggacaagtagattactatgggttatattattgg　　　　　C:60
 G  E  C  E  C  T  I  V  E  G  Q  V  D  Y  Y  G  L  Y  Y  W 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3282
tgtgatggagaaaaaatatattttgtaaaatttagtaacgatgcaaagcaatattgtgta　　　　　C:60
 C  D  G  E  K  I  Y  F  V  K  F  S  N  D  A  K  Q  Y  C  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3342
acaggagtatgggaagtacatgtgggtggtcaggtaattgtttgtcctgcatctgtatct　　　　　C:60
 T  G  V  W  E  V  H  V  G  G  Q  V  I  V  C  P  A  S  V  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3402
agtaacgaagtatccactactgaaactgctgtccacctatgcaccgaaacctccaagacc　　　　　C:60
 S  N  E  V  S  T  T  E  T  A  V  H  L  C  T  E  T  S  K  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3462
tccgcagtgtccgtgggtgccaaagacacacacctacaaccaccacagaaacgacgacga　　　　　C:60
 S  A  V  S  V  G  A  K  D  T  H  L  Q  P  P  Q  K  R  R  R 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3522
ccagacgtcacagactccagaaacaccaagtaccccaacaaccttttgcggggacaacaa　　　　　C:60
 P  D  V  T  D  S  R  N  T  K  Y  P  N  N  L  L  R  G  Q  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3582
tccgtggacagtactacacggggactcgtcactgcaactgagtgcacaaacaaaggacgg　　　　　C:60
 S  V  D  S  T  T  R  G  L  V  T  A  T  E  C  T  N  K  G  R 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3642
gttgcacatacaacttgtactgcacctataatacacctaaaaggtgatcctaatagttta　　　　　C:60
 V  A  H  T  T  C  T  A  P  I  I  H  L  K  G  D  P  N  S  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3702
aaatgtttaagatatagggtaaaaacacataaaagtttgtatgttcaaatttcatctacc　　　　　C:60
 K  C  L  R  Y  R  V  K  T  H  K  S  L  Y  V  Q  I  S  S  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3762
tggcattggaccagtaatgaatgtacaaataataaactaggtattgtaacaataacgtac　　　　　C:60
 W  H  W  T  S  N  E  C  T  N  N  K  L  G  I  V  T  I  T  Y 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3822
agtgatgaaacacaacgtcaacaatttttaaaaactgttaaaataccaaatactgtgcaa　　　　　C:60
 S  D  E  T  Q  R  Q  Q  F  L  K  T  V  K  I  P  N  T  V  Q 　　　　　P:20


         .         .                                        　　　　　G:3849
gttatacaaggtgtcatgtcattgtga                                 　　　　　C:27
 V  I  Q  G  V  M  S  L                                     　　　　　P:8

DETAIL

DOMAIN & MUTATION