HPV45 E2

Accession: H000036

Uniprot: P36794

Protein: E2

Organism: Human papillomavirus type 45

Function

It is responsible for recognition and binding of origin of replication. It exists in two forms such as full length (transcriptional transactivator) and truncated (transcriptional repressor). The ratio of these found in the heterotrimeric complex, formed b

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PPV_E2_N	2790-3392	603	E2 (early) protein, N terminal;
CDD	PPV_E2_C	3642-3869	228	E2 (early) protein, C terminal;
MOTIF_SCAN		2847-2858	12
MOTIF_SCAN		2973-2984	12
MOTIF_SCAN		3375-3386	12
MOTIF_SCAN		2781-2792	12
MOTIF_SCAN		2793-2804	12
MOTIF_SCAN		2919-2930	12
MOTIF_SCAN		3063-3074	12
MOTIF_SCAN		3075-3086	12
MOTIF_SCAN		3306-3317	12
MOTIF_SCAN		3390-3401	12
MOTIF_SCAN		3810-3821	12
MOTIF_SCAN		3027-3044	18
MOTIF_SCAN		3153-3170	18
MOTIF_SCAN		3324-3341	18
MOTIF_SCAN		3750-3767	18
MOTIF_SCAN		2781-2789	9
MOTIF_SCAN		2799-2807	9
MOTIF_SCAN		2919-2927	9
MOTIF_SCAN		3456-3464	9
MOTIF_SCAN		3480-3488	9
MOTIF_SCAN		3510-3518	9
MOTIF_SCAN		3672-3680	9
MOTIF_SCAN		3270-3293	24
MOTIF_SCAN		2775-2969	195
MOTIF_SCAN		3642-3869	228
MOTIF_SCAN		2790-3392	603
MOTIF_SCAN		3642-3869	228
MOTIF_SCAN		2790-3392	603
INTERPROSCAN		3633-3872	240
INTERPROSCAN		3642-3860	219
INTERPROSCAN		3090-3392	303
INTERPROSCAN		2790-3389	600
INTERPROSCAN		3639-3869	231
INTERPROSCAN		3600-3869	270
INTERPROSCAN		2790-3371	582
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2790-3392	603
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3642-3869	228
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2802-3008	207
MOTIF_SEAR_IN_PROT		2790-3371	582
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3642-3860	219
MOTIF_SEAR_IN_PROT		3108-3335	228
PROSITE_SCAN		2781-2789	9
PROSITE_SCAN		2781-2792	12
PROSITE_SCAN		2793-2804	12
PROSITE_SCAN		2799-2807	9
PROSITE_SCAN		2847-2858	12
PROSITE_SCAN		2919-2927	9
PROSITE_SCAN		2919-2930	12
PROSITE_SCAN		2973-2984	12
PROSITE_SCAN		3027-3044	18
PROSITE_SCAN		3063-3074	12
PROSITE_SCAN		3075-3086	12
PROSITE_SCAN		3153-3170	18
PROSITE_SCAN		3270-3293	24
PROSITE_SCAN		3306-3317	12
PROSITE_SCAN		3324-3341	18
PROSITE_SCAN		3375-3386	12
PROSITE_SCAN		3390-3401	12
PROSITE_SCAN		3456-3464	9
PROSITE_SCAN		3480-3488	9
PROSITE_SCAN		3510-3518	9
PROSITE_SCAN		3672-3680	9
PROSITE_SCAN		3750-3767	18
PROSITE_SCAN		3810-3821	12
SBASE		2790-3392	603
SBASE		3459-3581	123
SBASE		3639-3869	231
RADAR		2769-2981	213
RADAR		3648-3854	207
TMPRED_SERVER		3207-3263	57
TMPRED_SERVER		3816-3875	60
TMPRED_SERVER		3822-3875	54
UNIPROTKB		2769-3389	621
UNIPROTKB		3636-3872	237

Sequence

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2828
atgaagatgcagacaccgaaggaatccctttcggaacgtttaagtgcgttacaggacaaa　　　　　C:60
 M  K  M  Q  T  P  K  E  S  L  S  E  R  L  S  A  L  Q  D  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2888
atactagaccactatgaaaatgacagtaaagacataaacagccaaataagttattggcaa　　　　　C:60
 I  L  D  H  Y  E  N  D  S  K  D  I  N  S  Q  I  S  Y  W  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2948
cttatacgtttggaaaatgcaatactatttacagcaagggaacatggtattaccaaacta　　　　　C:60
 L  I  R  L  E  N  A  I  L  F  T  A  R  E  H  G  I  T  K  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3008
aaccaccaggtggtgcctcctattaacatttcaaaaagcaaagcacataaagctattgaa　　　　　C:60
 N  H  Q  V  V  P  P  I  N  I  S  K  S  K  A  H  K  A  I  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3068
ctgcaaatggccttaaagggccttgcacaaagcaagtataacaatgaggaatggacactg　　　　　C:60
 L  Q  M  A  L  K  G  L  A  Q  S  K  Y  N  N  E  E  W  T  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3128
caagatacatgcgaggaactatggaatacagaaccgtcgcagtgttttaaaaaaggcggt　　　　　C:60
 Q  D  T  C  E  E  L  W  N  T  E  P  S  Q  C  F  K  K  G  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3188
aaaaccgtgcacgtatactttgatggcaacaaggacaactgtatgaactatgtagtatgg　　　　　C:60
 K  T  V  H  V  Y  F  D  G  N  K  D  N  C  M  N  Y  V  V  W 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3248
gacagtatatattatataactgagacagggatatgggacaaaacagcagcatgtgttagc　　　　　C:60
 D  S  I  Y  Y  I  T  E  T  G  I  W  D  K  T  A  A  C  V  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3308
tattggggtgtatattatataaaagatggagataccacatattatgtacaatttaaaagc　　　　　C:60
 Y  W  G  V  Y  Y  I  K  D  G  D  T  T  Y  Y  V  Q  F  K  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3368
gaatgtgagaaatatggaaatagtaatacgtgggaagtacaatatgggggcaatgtaatt　　　　　C:60
 E  C  E  K  Y  G  N  S  N  T  W  E  V  Q  Y  G  G  N  V  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3428
gattgtaatgactctatgtgcagtaccagtgacgacacggtatccgctactcagattgtt　　　　　C:60
 D  C  N  D  S  M  C  S  T  S  D  D  T  V  S  A  T  Q  I  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3488
agacagctacaacacgcctccacgtcgacccccaaaaccgcatccgtgggcaccccaaaa　　　　　C:60
 R  Q  L  Q  H  A  S  T  S  T  P  K  T  A  S  V  G  T  P  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3548
ccccacatccagacgccggctactaagcgacctagacagtgtggactcacagagcagcac　　　　　C:60
 P  H  I  Q  T  P  A  T  K  R  P  R  Q  C  G  L  T  E  Q  H 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3608
cacggacgtgtcaacacccacgtgcacaacccgctcctgtgttcaagtacaagtaacaac　　　　　C:60
 H  G  R  V  N  T  H  V  H  N  P  L  L  C  S  S  T  S  N  N 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3668
aaaagaaggaaagtgtgtagtggtaacactacgcctataatacacttaaaaggtgacaaa　　　　　C:60
 K  R  R  K  V  C  S  G  N  T  T  P  I  I  H  L  K  G  D  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3728
aacagtttgaaatgtttaagatataggctacgcaaatatgcagaccattactcagaaata　　　　　C:60
 N  S  L  K  C  L  R  Y  R  L  R  K  Y  A  D  H  Y  S  E  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3788
tcctccacctggcattggacaggttgtaataaaaacactggtatattaactgtaacatat　　　　　C:60
 S  S  T  W  H  W  T  G  C  N  K  N  T  G  I  L  T  V  T  Y 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3848
aatagtgaggtacaaagaaatacctttttggatgtagttactattcctaacagtgtacaa　　　　　C:60
 N  S  E  V  Q  R  N  T  F  L  D  V  V  T  I  P  N  S  V  Q 　　　　　P:20


         .         .                                        　　　　　G:3875
atctcggtgggatacatgactatatga                                 　　　　　C:27
 I  S  V  G  Y  M  T  I                                     　　　　　P:8

DETAIL

DOMAIN & MUTATION