HPV59 E1

Accession: H000019

Uniprot: Q81966

Protein: E1

Organism: Human papillomavirus type 59

Function

ATP-dependent DNA helicase required for initiation of viral DNA replication. It forms a complex with the viral E2 protein.

Domain&Motif

method	domain/motif name	position	length	description
CDD	PPV_E1_C	1481-2776	1296	Papillomavirus helicase; This protein is a DNA helicase that is required for initiation of viral DNA replication. This protein forms a complex with the E2 protein pfam00508.
CDD	PPV_E1_N	872-1291	420	E1 Protein, N terminal domain;
CDD	Parvo_NS1	2171-2560	390	Parvovirus non-structural protein NS1; This family also contains the NS2 protein. Parvoviruses encode two non-structural proteins, NS1 and NS2. The mRNA for NS2 contains the coding sequence for the first 87 amino acids of NS1, then by an alternative splic
CDD	PHA02774	872-2803	1932	E1; Provisional
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Sequence

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atggccgattcggaaggtacagatggggaagggacggggtgcaatggatggttttttgtg　　　　　C:60
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caggcaatagtagataaaaaaacaggtgacaaaatttcagatgacgaggatgaaaatgca　　　　　C:60
 Q  A  I  V  D  K  K  T  G  D  K  I  S  D  D  E  D  E  N  A 　　　　　P:20


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acagatacaggttcagacttggtagattttattgatgataccacaacaatttgtgtacag　　　　　C:60
 T  D  T  G  S  D  L  V  D  F  I  D  D  T  T  T  I  C  V  Q 　　　　　P:20


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gcagagcgcgagacagcacaggccttgtttaatgtgcaggaagcccaaagggatgcacgg　　　　　C:60
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gaaatgcatgttttaaaacgaaagtttgggtgcagtatagaaaacagtagtgagaaagcg　　　　　C:60
 E  M  H  V  L  K  R  K  F  G  C  S  I  E  N  S  S  E  K  A 　　　　　P:20


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aaagtaaaaagaaggttaataacagtgccagacagcggctatggctattctgaagtggaa　　　　　C:60
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atgctcgagactcaggtaaccgtggagaatactggaaatggggatagcaatggcagtgtt　　　　　C:60
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tgtagcgacagtcaaatagactgtagcgacagcagtaacatggatgttgaaaacatagtt　　　　　C:60
 C  S  D  S  Q  I  D  C  S  D  S  S  N  M  D  V  E  N  I  V 　　　　　P:20


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ccaacatcccccactaatcaattgttacagttattacatagcaaaaataagaaagcagct　　　　　C:60
 P  T  S  P  T  N  Q  L  L  Q  L  L  H  S  K  N  K  K  A  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:1531
atgtatgcaaaatttaaagaattgtatgggttatcatttcaagatttggttaggacattt　　　　　C:60
 M  Y  A  K  F  K  E  L  Y  G  L  S  F  Q  D  L  V  R  T  F 　　　　　P:20


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 K  S  D  R  T  T  C  S  D  W  V  T  A  I  F  G  V  N  P  T 　　　　　P:20


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 L  D  C  A  W  G  V  V  I  L  A  L  L  R  Y  K  C  G  K  N 　　　　　P:20


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agaataacagttgcaaaaggacttagcacattactacatgtaccagatacgtgcatgtta　　　　　C:60
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gaagatgcagacagtgatggacaccctttcgcagcgtttaagtgtgttacaggatcaaat　　　　　C:60
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DETAIL

DOMAIN & MUTATION

HPV59 E1

Accession: H000019

Uniprot: Q81966

Protein: E1

Organism: Human papillomavirus type 59

Function

Domain&Motif

Sequence