HPV126 L1

Accession: H003270
NC: YP_004934018.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 12

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5332
ATGGCTACATGGATGCCCAGTTCTGGACGCTTGTATTTACCTCCTGCTCAGCCCGTTGCA     C:60
M A T W M P S S G R L Y L P P A Q P V A      P:20


. . . . . .     G:5392
AGAGTGTATTCTACTGATGAATATGTTATTCCTACCGATATTTATTTTCATGCAAATACT     C:60
R V Y S T D E Y V I P T D I Y F H A N T      P:20


. . . . . .     G:5452
GAAAGACTGTTAACAGTAGGCCATCCCTATTTTGATATTGTTGATTCTAATGATAATGTT     C:60
E R L L T V G H P Y F D I V D S N D N V      P:20


. . . . . .     G:5512
ACAGTGCAGGTTCCAAAGGTTTCTGCAAATCAATTTAGAGTTCTTCGAATGAAGTTGCCA     C:60
T V Q V P K V S A N Q F R V L R M K L P      P:20


. . . . . .     G:5572
GATCCTAATAAATTTGCTCTAATTGATACTGATATTTATAATCCAGAAAAGGAACGTTTA     C:60
D P N K F A L I D T D I Y N P E K E R L      P:20


. . . . . .     G:5632
GTATGGAGATTATATGGGATTGAAATTGATAGAGGCGGACCTTTGGGAATTGGCACAACA     C:60
V W R L Y G I E I D R G G P L G I G T T      P:20


. . . . . .     G:5692
GGTCATCCTTTATTTGATAAACAAACAGACACTGAGAATCCAAGTGCATATCCTAATTTT     C:60
G H P L F D K Q T D T E N P S A Y P N F      P:20


. . . . . .     G:5752
GGAAATAGTACTGAAAACAGACTGAATATTTCTTGTGATCCTAAACAAAATCAGTTATTT     C:60
G N S T E N R L N I S C D P K Q N Q L F      P:20


. . . . . .     G:5812
ATTGTTGGTTGTGCTCCAGCCTTAGGGCAACATTGGGATGTGGGGGAACCATGTGAACCC     C:60
I V G C A P A L G Q H W D V G E P C E P      P:20


. . . . . .     G:5872
CCAGGTCAAAAGGGTACGTGCCCTCCTATCAAACTTATACATTCGCCTATACAAGATGGC     C:60
P G Q K G T C P P I K L I H S P I Q D G      P:20


. . . . . .     G:5932
GATATGAGTGATATAGGATTTGGGGCAGTTAATTTTGCTACATTTTCTGAGAGTAGATCA     C:60
D M S D I G F G A V N F A T F S E S R S      P:20


. . . . . .     G:5992
GATGCTCCTTTAGAAATCATTAACTCTATCTGTAAGTGGCCTGATTTTATTCAGATGACT     C:60
D A P L E I I N S I C K W P D F I Q M T      P:20


. . . . . .     G:6052
AAGGATGTTTATGGTGATCGTTTGTTTTTCTTTGGAAAACGTGAACAAGTCTATGCAAGA     C:60
K D V Y G D R L F F F G K R E Q V Y A R      P:20


. . . . . .     G:6112
CATATGTTTTGTAAAGATGGAGCTGTTGGCGACAGTATCCCTGAGGATGTGAATGGTGAT     C:60
H M F C K D G A V G D S I P E D V N G D      P:20


. . . . . .     G:6172
CACAGACGCTTTATAGTACATCCAGACACAGGTACACCACCAGACTTAAATTTAGGAAAT     C:60
H R R F I V H P D T G T P P D L N L G N      P:20


. . . . . .     G:6232
AGCACATATTTTCCAATGCCGAGTGGCTCACTGGTAACCAGTGAAACACAGCTGTTTAAT     C:60
S T Y F P M P S G S L V T S E T Q L F N      P:20


. . . . . .     G:6292
AGACCCTTTTGGTTACATAGGGCACAAGGTAAAAATAATGGTATATGTTGGGGTAATAAC     C:60
R P F W L H R A Q G K N N G I C W G N N      P:20


. . . . . .     G:6352
TTGTTTGTTACCTTTTTGGATAACACACATAACACAAATTTTATATTATCTGTATATAAG     C:60
L F V T F L D N T H N T N F I L S V Y K      P:20


. . . . . .     G:6412
GAAGATGAGCCTATGGGTGCTCAATATAAATATAAGTCAACTCATTTCAGACATTTTATG     C:60
E D E P M G A Q Y K Y K S T H F R H F M      P:20


. . . . . .     G:6472
AGACATACAGAAGAAGTGGAGGTTGAGCTTATTTTGCAGCTGTGTAAGATTCCACTGGAG     C:60
R H T E E V E V E L I L Q L C K I P L E      P:20


. . . . . .     G:6532
GCTGAAATTTTAGCTCATATAAATGCTATGAACTCAGCTATTTTGGATGAGTGGCAGTTA     C:60
A E I L A H I N A M N S A I L D E W Q L      P:20


. . . . . .     G:6592
GCCTTTGTACCAGCACCTCCACAAAACATAGAAGACACCTATCGCTTTATAAAATCACTA     C:60
A F V P A P P Q N I E D T Y R F I K S L      P:20


. . . . . .     G:6652
GCTACTATCTGTCCTAAAGACGCTCAACAGAAGCCACCTGCAGACCCATTTAAAGATTTA     C:60
A T I C P K D A Q Q K P P A D P F K D L      P:20


. . . . . .     G:6712
CATTTTTGGACAGTTGATTTGTCAGATAGATTCAGTTCTGATTTGGATCAAACACCTTTG     C:60
H F W T V D L S D R F S S D L D Q T P L      P:20


. . . . . .     G:6772
GGACGCAAGTTTCTGTATCAAATGGGAAAGCTGTCAACTAATAGGAAACGTCTCAGAGAT     C:60
G R K F L Y Q M G K L S T N R K R L R D      P:20


. . . . . .     G:6832
ACTTATGCTTCCACAACTCCATCTACTAGGCGCAGAACAAAGCGCAAACGTGTCAGTGTG     C:60
T Y A S T T P S T R R R T K R K R V S V      P:20


.      G:6844
TCTCGTTCTTAA      C:12
S R S      P:3