HPV48 L1
Accession: H003224
NC: NP_043422.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 48
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5261
ATGGCTCTGTGGTCTGCAGTCCCTGGCAAGGTTTACCTACCTCCTAGTGCACCAGTAGCT C:60
M A L W S A V P G K V Y L P P S A P V A P:20
. . . . . . G:5321
CGTGTGTTGCGCACTGATGAATACGTGCAAGAAACGGATGTATATTTTTATACAAGCACT C:60
R V L R T D E Y V Q E T D V Y F Y T S T P:20
. . . . . . G:5381
GAAAGACTTTTAATAGTTGGTAATCCTTATTTTGATGTTGAAAACAGAGACACTATAACA C:60
E R L L I V G N P Y F D V E N R D T I T P:20
. . . . . . G:5441
GTACCTAAAGTTTCTGCTAATCAATACCGAGTATTTAGATGTAAACTTCCAGATCCTAAC C:60
V P K V S A N Q Y R V F R C K L P D P N P:20
. . . . . . G:5501
AAGTTTGCTCTAGTTGATAAAAATTTATATAATTCAGATAAGGAACGTTTAGTTTGGAAA C:60
K F A L V D K N L Y N S D K E R L V W K P:20
. . . . . . G:5561
CTTGTTGGTTTGGAAGTAGGCAGAGGGGGTCCTCTTGGCGTAGGATCTACAGGTCATCCT C:60
L V G L E V G R G G P L G V G S T G H P P:20
. . . . . . G:5621
TTACTAAATAAGATAGGGGACACAGAAAATCCTAGCTTTTATTTAGGAGAACAAACAAAG C:60
L L N K I G D T E N P S F Y L G E Q T K P:20
. . . . . . G:5681
GATGAGAGACAAAATGTTTCCATGGATCCTAAGCAGAGTCAGATACTAATAGTTGGTTGT C:60
D E R Q N V S M D P K Q S Q I L I V G C P:20
. . . . . . G:5741
GCTCCAGCCACTGGAGAATACTGGGATTTAGCTAAACCATGCAATGATTTGGAAAACGGG C:60
A P A T G E Y W D L A K P C N D L E N G P:20
. . . . . . G:5801
GCTGCACCACCAATTCAACTAGTTAATACTGTTATTCAGGATGGTGATATGGGAGATATA C:60
A A P P I Q L V N T V I Q D G D M G D I P:20
. . . . . . G:5861
GGCTTTGGGGCTGCTAATTTTCCTAAGTTGATGCAGGATCGTGCTGGCGTCCCTCTAGAG C:60
G F G A A N F P K L M Q D R A G V P L E P:20
. . . . . . G:5921
TTAATAGATTCTATTAGTATATGGCCAGATTTTTTAAAGATGACCAAAGATATTTATGGA C:60
L I D S I S I W P D F L K M T K D I Y G P:20
. . . . . . G:5981
GACTCTGTCTTCTTTTTTGGTAAACGGGAACAATGTTATGCTCGTCATCTTTTTGCAAGA C:60
D S V F F F G K R E Q C Y A R H L F A R P:20
. . . . . . G:6041
GCTGGCCAAATGGGGGAGCCTATACCAACAGAAAATGGAGTATATTATATAACTCCTGAT C:60
A G Q M G E P I P T E N G V Y Y I T P D P:20
. . . . . . G:6101
TCTGCCGATCAAAACAACAGATCTTCTCATTTAGGATCTTCTGTGTATTTTACAACACCA C:60
S A D Q N N R S S H L G S S V Y F T T P P:20
. . . . . . G:6161
AGTGGATCCTTGAATACTAGCGATTCTCAGTTATTTAATAGGCCTTATTGGCTTAGACGA C:60
S G S L N T S D S Q L F N R P Y W L R R P:20
. . . . . . G:6221
GCCCAGGGAACAAATAATGGCATTTGTTGGGGAAATGAGCTGTTTATTACAGTTTTTGAT C:60
A Q G T N N G I C W G N E L F I T V F D P:20
. . . . . . G:6281
AATACTCATAATGTGAATTTTACTATTAGTGTTAAGAATGATAAAACTGCATTAACTGAA C:60
N T H N V N F T I S V K N D K T A L T E P:20
. . . . . . G:6341
AACTACATAGATAATGGTTACAAATATAATAATGCAGATTTTAAACAATATCTTCGACAT C:60
N Y I D N G Y K Y N N A D F K Q Y L R H P:20
. . . . . . G:6401
ACAGAAGAATATGAAATAGAGTTGGTTTTTCAGTTATGCAAAGTGAACTTGACTGCAGAT C:60
T E E Y E I E L V F Q L C K V N L T A D P:20
. . . . . . G:6461
GTTCTGGCACATTTACACGTTATGAATCCCAGAATATTAGAGGAGTGGCAATTAGCTTTT C:60
V L A H L H V M N P R I L E E W Q L A F P:20
. . . . . . G:6521
GTTCCACCAGCTCCAACGGGCATTGAAGATACTTACAGGTATATCAAATCCATGGCTACT C:60
V P P A P T G I E D T Y R Y I K S M A T P:20
. . . . . . G:6581
AAATGCCCTACTGCTGAACCAGAAGAAGACACAGATCCATACAAAGCTTACAGTTTCTGG C:60
K C P T A E P E E D T D P Y K A Y S F W P:20
. . . . . . G:6641
ACTTTAGATATGACAGAGCGCTTCTCGTCTGATTTAAGTCAGTTTTCCTTGGGTCGAAAA C:60
T L D M T E R F S S D L S Q F S L G R K P:20
. . . . . . G:6701
TTTTTATATCAAACTGGTTTGTTAAATGGTAAACGAGCTAGAACAGACTATACAGCTGCA C:60
F L Y Q T G L L N G K R A R T D Y T A A P:20
. . . . G:6743
GGATCTAGTACCAGATCTACAAAGCGTAGGAGAGTAAGATAG C:42
G S S T R S T K R R R V R P:13
