HPV48 L1

Accession: H003224
NC: NP_043422.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 48

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5261
ATGGCTCTGTGGTCTGCAGTCCCTGGCAAGGTTTACCTACCTCCTAGTGCACCAGTAGCT     C:60
M A L W S A V P G K V Y L P P S A P V A      P:20


. . . . . .     G:5321
CGTGTGTTGCGCACTGATGAATACGTGCAAGAAACGGATGTATATTTTTATACAAGCACT     C:60
R V L R T D E Y V Q E T D V Y F Y T S T      P:20


. . . . . .     G:5381
GAAAGACTTTTAATAGTTGGTAATCCTTATTTTGATGTTGAAAACAGAGACACTATAACA     C:60
E R L L I V G N P Y F D V E N R D T I T      P:20


. . . . . .     G:5441
GTACCTAAAGTTTCTGCTAATCAATACCGAGTATTTAGATGTAAACTTCCAGATCCTAAC     C:60
V P K V S A N Q Y R V F R C K L P D P N      P:20


. . . . . .     G:5501
AAGTTTGCTCTAGTTGATAAAAATTTATATAATTCAGATAAGGAACGTTTAGTTTGGAAA     C:60
K F A L V D K N L Y N S D K E R L V W K      P:20


. . . . . .     G:5561
CTTGTTGGTTTGGAAGTAGGCAGAGGGGGTCCTCTTGGCGTAGGATCTACAGGTCATCCT     C:60
L V G L E V G R G G P L G V G S T G H P      P:20


. . . . . .     G:5621
TTACTAAATAAGATAGGGGACACAGAAAATCCTAGCTTTTATTTAGGAGAACAAACAAAG     C:60
L L N K I G D T E N P S F Y L G E Q T K      P:20


. . . . . .     G:5681
GATGAGAGACAAAATGTTTCCATGGATCCTAAGCAGAGTCAGATACTAATAGTTGGTTGT     C:60
D E R Q N V S M D P K Q S Q I L I V G C      P:20


. . . . . .     G:5741
GCTCCAGCCACTGGAGAATACTGGGATTTAGCTAAACCATGCAATGATTTGGAAAACGGG     C:60
A P A T G E Y W D L A K P C N D L E N G      P:20


. . . . . .     G:5801
GCTGCACCACCAATTCAACTAGTTAATACTGTTATTCAGGATGGTGATATGGGAGATATA     C:60
A A P P I Q L V N T V I Q D G D M G D I      P:20


. . . . . .     G:5861
GGCTTTGGGGCTGCTAATTTTCCTAAGTTGATGCAGGATCGTGCTGGCGTCCCTCTAGAG     C:60
G F G A A N F P K L M Q D R A G V P L E      P:20


. . . . . .     G:5921
TTAATAGATTCTATTAGTATATGGCCAGATTTTTTAAAGATGACCAAAGATATTTATGGA     C:60
L I D S I S I W P D F L K M T K D I Y G      P:20


. . . . . .     G:5981
GACTCTGTCTTCTTTTTTGGTAAACGGGAACAATGTTATGCTCGTCATCTTTTTGCAAGA     C:60
D S V F F F G K R E Q C Y A R H L F A R      P:20


. . . . . .     G:6041
GCTGGCCAAATGGGGGAGCCTATACCAACAGAAAATGGAGTATATTATATAACTCCTGAT     C:60
A G Q M G E P I P T E N G V Y Y I T P D      P:20


. . . . . .     G:6101
TCTGCCGATCAAAACAACAGATCTTCTCATTTAGGATCTTCTGTGTATTTTACAACACCA     C:60
S A D Q N N R S S H L G S S V Y F T T P      P:20


. . . . . .     G:6161
AGTGGATCCTTGAATACTAGCGATTCTCAGTTATTTAATAGGCCTTATTGGCTTAGACGA     C:60
S G S L N T S D S Q L F N R P Y W L R R      P:20


. . . . . .     G:6221
GCCCAGGGAACAAATAATGGCATTTGTTGGGGAAATGAGCTGTTTATTACAGTTTTTGAT     C:60
A Q G T N N G I C W G N E L F I T V F D      P:20


. . . . . .     G:6281
AATACTCATAATGTGAATTTTACTATTAGTGTTAAGAATGATAAAACTGCATTAACTGAA     C:60
N T H N V N F T I S V K N D K T A L T E      P:20


. . . . . .     G:6341
AACTACATAGATAATGGTTACAAATATAATAATGCAGATTTTAAACAATATCTTCGACAT     C:60
N Y I D N G Y K Y N N A D F K Q Y L R H      P:20


. . . . . .     G:6401
ACAGAAGAATATGAAATAGAGTTGGTTTTTCAGTTATGCAAAGTGAACTTGACTGCAGAT     C:60
T E E Y E I E L V F Q L C K V N L T A D      P:20


. . . . . .     G:6461
GTTCTGGCACATTTACACGTTATGAATCCCAGAATATTAGAGGAGTGGCAATTAGCTTTT     C:60
V L A H L H V M N P R I L E E W Q L A F      P:20


. . . . . .     G:6521
GTTCCACCAGCTCCAACGGGCATTGAAGATACTTACAGGTATATCAAATCCATGGCTACT     C:60
V P P A P T G I E D T Y R Y I K S M A T      P:20


. . . . . .     G:6581
AAATGCCCTACTGCTGAACCAGAAGAAGACACAGATCCATACAAAGCTTACAGTTTCTGG     C:60
K C P T A E P E E D T D P Y K A Y S F W      P:20


. . . . . .     G:6641
ACTTTAGATATGACAGAGCGCTTCTCGTCTGATTTAAGTCAGTTTTCCTTGGGTCGAAAA     C:60
T L D M T E R F S S D L S Q F S L G R K      P:20


. . . . . .     G:6701
TTTTTATATCAAACTGGTTTGTTAAATGGTAAACGAGCTAGAACAGACTATACAGCTGCA     C:60
F L Y Q T G L L N G K R A R T D Y T A A      P:20


. . . .      G:6743
GGATCTAGTACCAGATCTACAAAGCGTAGGAGAGTAAGATAG      C:42
G S S T R S T K R R R V R      P:13