HPV50 L1

Accession: H003223
NC: NP_043429.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 50

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5290
ATGGCTCATTGGTCCTCAACCTCTGGAAAGTTATACCTTCCACCAAGTACTCCTGTTGCC     C:60
M A H W S S T S G K L Y L P P S T P V A      P:20


. . . . . .     G:5350
AGAGTTTTAAGCACCGATGAATATGTGAAAGAAACTGATGTTTACTTTCATGCACGCAGT     C:60
R V L S T D E Y V K E T D V Y F H A R S      P:20


. . . . . .     G:5410
GAGCGTTTACTAATTGTGGGACACCCATATTATGATATAGAAGATGGTGGAGATATCAAA     C:60
E R L L I V G H P Y Y D I E D G G D I K      P:20


. . . . . .     G:5470
GTTCCTAAAGTATCAGCAAATCAATACAGAGTTTTTCGTTGTGAATTACCAGATCCTAAC     C:60
V P K V S A N Q Y R V F R C E L P D P N      P:20


. . . . . .     G:5530
AAGTTTGCTCTAATTGATACTACATTGTATAACTCAGATACAGAACGTTTGGTTTGGAAA     C:60
K F A L I D T T L Y N S D T E R L V W K      P:20


. . . . . .     G:5590
CTAGTAGGTATAGAAGTCGGGAGAGGTGGGCCTTTAGGTGTTGGATCTACTGGTCATCCC     C:60
L V G I E V G R G G P L G V G S T G H P      P:20


. . . . . .     G:5650
TTGTTTAATAAGGTTGGAGACACAGAAAATCCTAGCTTTTACTTAGGTCCACAAGAAAAA     C:60
L F N K V G D T E N P S F Y L G P Q E K      P:20


. . . . . .     G:5710
GATGAAAGACAAAACTTGTCTATAGATCCTAAACAAACACAGTTATTGATTGTAGGCTGC     C:60
D E R Q N L S I D P K Q T Q L L I V G C      P:20


. . . . . .     G:5770
AAACCAGCTGTTGGTGAATATTGGGATTTAGCAGAACCTTGTGACAAAAACAGCTTAAAT     C:60
K P A V G E Y W D L A E P C D K N S L N      P:20


. . . . . .     G:5830
AATGGCAAGTGTCCTCCAATACAACTAGTAAACAGTTATATTCAGGATGGTGATATGGGA     C:60
N G K C P P I Q L V N S Y I Q D G D M G      P:20


. . . . . .     G:5890
GATATAGGATTTGGTAATGCAAACTTTCCTAAACTACAACAGGACAGAGCAGGGGTCCCT     C:60
D I G F G N A N F P K L Q Q D R A G V P      P:20


. . . . . .     G:5950
TTAGATATAGTGGATTCAATCAGCTTATGGCCTGATCTATTAAAAATGACTAAAGATGTC     C:60
L D I V D S I S L W P D L L K M T K D V      P:20


. . . . . .     G:6010
TATGGGGACCATGTGTTTTTCTATGCAAAGCAAGAGCAATTATATGCCAGACATTTGTTT     C:60
Y G D H V F F Y A K Q E Q L Y A R H L F      P:20


. . . . . .     G:6070
ACCCATGCAGGACCAATTGGGGAACCTATACCTAATGTCTCAGGAGTTTATAATTATGCA     C:60
T H A G P I G E P I P N V S G V Y N Y A      P:20


. . . . . .     G:6130
GTAAACCCTAATCAACCAGAGCAAAATCGTAGAACCAATATTGGTTCCTACTTATATTTT     C:60
V N P N Q P E Q N R R T N I G S Y L Y F      P:20


. . . . . .     G:6190
ACTACACCAAGTGGATCTTTAAATACAAGCAGTTCACAGTTATTTAATAGACCATATTGG     C:60
T T P S G S L N T S S S Q L F N R P Y W      P:20


. . . . . .     G:6250
ATTCGCAGAGCTCAGGGTACGAACAATTGTATTTGTTGGGGTAATGAGGTATTTGTTACA     C:60
I R R A Q G T N N C I C W G N E V F V T      P:20


. . . . . .     G:6310
GTATTTGATAACACCAGAAACATTAACTTTAATATTAGTGTTAAGAAAGATGTCAATCCT     C:60
V F D N T R N I N F N I S V K K D V N P      P:20


. . . . . .     G:6370
TTGGATCCTTTAAATGTAGCAAGTTCTTATATGTACTCAAAGGATGATTTTAATCAGTAC     C:60
L D P L N V A S S Y M Y S K D D F N Q Y      P:20


. . . . . .     G:6430
AGCCGTCATACTGAAGAATATGAATTAGAATTTATATTTCAGTTATGTAAAGTAGGATTG     C:60
S R H T E E Y E L E F I F Q L C K V G L      P:20


. . . . . .     G:6490
GATGCTGATATATTAGCTCATCTTAATGTAATGGACCCCAGAATTTTGGAAAATTGGCAA     C:60
D A D I L A H L N V M D P R I L E N W Q      P:20


. . . . . .     G:6550
TTAGCTTATGTTCCACCAGCTCCCAGTGGTATAGGCGATACTTACAGATACTTAAAATCT     C:60
L A Y V P P A P S G I G D T Y R Y L K S      P:20


. . . . . .     G:6610
GATGCTACAAAATGTCCTGCAAAAGACAGTAGCGCCGAAGTAGTAGACCCTTATAAAGAA     C:60
D A T K C P A K D S S A E V V D P Y K E      P:20


. . . . . .     G:6670
TATACTTTTTGGAATGTCAACCTTACAGAAAAGTTTTCGTCTGAACTTGATCAGTATGCC     C:60
Y T F W N V N L T E K F S S E L D Q Y A      P:20


. . . . . .     G:6730
CTAGGACGAAAATTTTTGTTTCAGACTGGATTATTAAAGAGAAGAGTTAGAACTGATTAC     C:60
L G R K F L F Q T G L L K R R V R T D Y      P:20


. . . .      G:6778
ACTGTTGCTACAGTTTCCAAACCAAACAAGAGAAAACGTACCAGATAA      C:48
T V A T V S K P N K R K R T R      P:15