HPV50 L1
Accession: H003223
NC: NP_043429.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 50
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5290
ATGGCTCATTGGTCCTCAACCTCTGGAAAGTTATACCTTCCACCAAGTACTCCTGTTGCC C:60
M A H W S S T S G K L Y L P P S T P V A P:20
. . . . . . G:5350
AGAGTTTTAAGCACCGATGAATATGTGAAAGAAACTGATGTTTACTTTCATGCACGCAGT C:60
R V L S T D E Y V K E T D V Y F H A R S P:20
. . . . . . G:5410
GAGCGTTTACTAATTGTGGGACACCCATATTATGATATAGAAGATGGTGGAGATATCAAA C:60
E R L L I V G H P Y Y D I E D G G D I K P:20
. . . . . . G:5470
GTTCCTAAAGTATCAGCAAATCAATACAGAGTTTTTCGTTGTGAATTACCAGATCCTAAC C:60
V P K V S A N Q Y R V F R C E L P D P N P:20
. . . . . . G:5530
AAGTTTGCTCTAATTGATACTACATTGTATAACTCAGATACAGAACGTTTGGTTTGGAAA C:60
K F A L I D T T L Y N S D T E R L V W K P:20
. . . . . . G:5590
CTAGTAGGTATAGAAGTCGGGAGAGGTGGGCCTTTAGGTGTTGGATCTACTGGTCATCCC C:60
L V G I E V G R G G P L G V G S T G H P P:20
. . . . . . G:5650
TTGTTTAATAAGGTTGGAGACACAGAAAATCCTAGCTTTTACTTAGGTCCACAAGAAAAA C:60
L F N K V G D T E N P S F Y L G P Q E K P:20
. . . . . . G:5710
GATGAAAGACAAAACTTGTCTATAGATCCTAAACAAACACAGTTATTGATTGTAGGCTGC C:60
D E R Q N L S I D P K Q T Q L L I V G C P:20
. . . . . . G:5770
AAACCAGCTGTTGGTGAATATTGGGATTTAGCAGAACCTTGTGACAAAAACAGCTTAAAT C:60
K P A V G E Y W D L A E P C D K N S L N P:20
. . . . . . G:5830
AATGGCAAGTGTCCTCCAATACAACTAGTAAACAGTTATATTCAGGATGGTGATATGGGA C:60
N G K C P P I Q L V N S Y I Q D G D M G P:20
. . . . . . G:5890
GATATAGGATTTGGTAATGCAAACTTTCCTAAACTACAACAGGACAGAGCAGGGGTCCCT C:60
D I G F G N A N F P K L Q Q D R A G V P P:20
. . . . . . G:5950
TTAGATATAGTGGATTCAATCAGCTTATGGCCTGATCTATTAAAAATGACTAAAGATGTC C:60
L D I V D S I S L W P D L L K M T K D V P:20
. . . . . . G:6010
TATGGGGACCATGTGTTTTTCTATGCAAAGCAAGAGCAATTATATGCCAGACATTTGTTT C:60
Y G D H V F F Y A K Q E Q L Y A R H L F P:20
. . . . . . G:6070
ACCCATGCAGGACCAATTGGGGAACCTATACCTAATGTCTCAGGAGTTTATAATTATGCA C:60
T H A G P I G E P I P N V S G V Y N Y A P:20
. . . . . . G:6130
GTAAACCCTAATCAACCAGAGCAAAATCGTAGAACCAATATTGGTTCCTACTTATATTTT C:60
V N P N Q P E Q N R R T N I G S Y L Y F P:20
. . . . . . G:6190
ACTACACCAAGTGGATCTTTAAATACAAGCAGTTCACAGTTATTTAATAGACCATATTGG C:60
T T P S G S L N T S S S Q L F N R P Y W P:20
. . . . . . G:6250
ATTCGCAGAGCTCAGGGTACGAACAATTGTATTTGTTGGGGTAATGAGGTATTTGTTACA C:60
I R R A Q G T N N C I C W G N E V F V T P:20
. . . . . . G:6310
GTATTTGATAACACCAGAAACATTAACTTTAATATTAGTGTTAAGAAAGATGTCAATCCT C:60
V F D N T R N I N F N I S V K K D V N P P:20
. . . . . . G:6370
TTGGATCCTTTAAATGTAGCAAGTTCTTATATGTACTCAAAGGATGATTTTAATCAGTAC C:60
L D P L N V A S S Y M Y S K D D F N Q Y P:20
. . . . . . G:6430
AGCCGTCATACTGAAGAATATGAATTAGAATTTATATTTCAGTTATGTAAAGTAGGATTG C:60
S R H T E E Y E L E F I F Q L C K V G L P:20
. . . . . . G:6490
GATGCTGATATATTAGCTCATCTTAATGTAATGGACCCCAGAATTTTGGAAAATTGGCAA C:60
D A D I L A H L N V M D P R I L E N W Q P:20
. . . . . . G:6550
TTAGCTTATGTTCCACCAGCTCCCAGTGGTATAGGCGATACTTACAGATACTTAAAATCT C:60
L A Y V P P A P S G I G D T Y R Y L K S P:20
. . . . . . G:6610
GATGCTACAAAATGTCCTGCAAAAGACAGTAGCGCCGAAGTAGTAGACCCTTATAAAGAA C:60
D A T K C P A K D S S A E V V D P Y K E P:20
. . . . . . G:6670
TATACTTTTTGGAATGTCAACCTTACAGAAAAGTTTTCGTCTGAACTTGATCAGTATGCC C:60
Y T F W N V N L T E K F S S E L D Q Y A P:20
. . . . . . G:6730
CTAGGACGAAAATTTTTGTTTCAGACTGGATTATTAAAGAGAAGAGTTAGAACTGATTAC C:60
L G R K F L F Q T G L L K R R V R T D Y P:20
. . . . G:6778
ACTGTTGCTACAGTTTCCAAACCAAACAAGAGAAAACGTACCAGATAA C:48
T V A T V S K P N K R K R T R P:15
