HPV60 L1
Accession: H003220
NC: NP_043443.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 60
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5454
ATGGCTCTTTGGTTGCAGACAGCTGGACAATTGTATCTTCCACCAAGCAAGCCTGTTGCT C:60
M A L W L Q T A G Q L Y L P P S K P V A P:20
. . . . . . G:5514
CGTGTACTCAGTACGGATGAATATGTACAGCCAACAAATTTAGTTTTTCATACAGGAACT C:60
R V L S T D E Y V Q P T N L V F H T G T P:20
. . . . . . G:5574
GACAGAATGCTAATTGTAGGACACCCTTATTTTGATATTATAGACAGTGGTTCAAATAAT C:60
D R M L I V G H P Y F D I I D S G S N N P:20
. . . . . . G:5634
ATTACTGTACCTAAATGTAGTGGAAATCAGTTTAGAGTTATGCGACTACTATTTCCAGAT C:60
I T V P K C S G N Q F R V M R L L F P D P:20
. . . . . . G:5694
CCAAACAAATTTGCAATGATAGACAGAGCTGTCTTTAACCCAGAAAGAGAGAGATTAGTC C:60
P N K F A M I D R A V F N P E R E R L V P:20
. . . . . . G:5754
TGGAGATTGGAAGGCCTTGAAATTGGTAGAGGTGGGCCTTTAGGAATTGGAACTTCTGGC C:60
W R L E G L E I G R G G P L G I G T S G P:20
. . . . . . G:5814
CATCCATTATTTAATAAATATGGAGATACAGAAAATCCTGCCGCATATCCTTTAAAGCAG C:60
H P L F N K Y G D T E N P A A Y P L K Q P:20
. . . . . . G:5874
AATAATGGTGATGACAATAGAATGGATGTTTCAATGGATCCAAAACAAATGCAATTGTTT C:60
N N G D D N R M D V S M D P K Q M Q L F P:20
. . . . . . G:5934
ATTGTAGGATGTAAACCAGCCACTGGTGAACACTGGGATATTGCTAAACCTTGTGATCCT C:60
I V G C K P A T G E H W D I A K P C D P P:20
. . . . . . G:5994
GCTCCAGCAAAAGGATCCTGTCCCCCAATTAAATTAACACAGTCTATAATTCAGGACGGT C:60
A P A K G S C P P I K L T Q S I I Q D G P:20
. . . . . . G:6054
GAAATGTGCGATACAGGCTTTGGAAATGCAAATTTTATTACCTTGCAAGAAGATAAATCA C:60
E M C D T G F G N A N F I T L Q E D K S P:20
. . . . . . G:6114
GGTGTTCCTCTAGATATTACCAATGAAATTTGTAAATATCCTGATTTACTAAAAATGACA C:60
G V P L D I T N E I C K Y P D L L K M T P:20
. . . . . . G:6174
AAAGATATCTATGGAGATGCAGTATTTTTCTTTGGTAAACGTGAACAAATTTATTCCAGG C:60
K D I Y G D A V F F F G K R E Q I Y S R P:20
. . . . . . G:6234
CATTATTTTGTAAGAGGAGGGATAGATGGAGATAGTTTGCCAGATTCTGGATATTACTTA C:60
H Y F V R G G I D G D S L P D S G Y Y L P:20
. . . . . . G:6294
GCACCACAAACTGATAAACCTCAAAATAACCTTGGTGGTTATAGTTACTTCCCTACACCA C:60
A P Q T D K P Q N N L G G Y S Y F P T P P:20
. . . . . . G:6354
AGTGGTTCTGTAGCTTCTAGTGATAATCAACTTTTTAATAGACCTTATTGGCTTCACAGA C:60
S G S V A S S D N Q L F N R P Y W L H R P:20
. . . . . . G:6414
GCCCAAGGTGCAAATAATGGTATTTGTTGGGGTAACCAATTATTCATTACTATAGTAGAT C:60
A Q G A N N G I C W G N Q L F I T I V D P:20
. . . . . . G:6474
AATACTCGAAATACTAATTTATCTATTTCAGTTTACAAACAAGATGCTGCTATTGATAAC C:60
N T R N T N L S I S V Y K Q D A A I D N P:20
. . . . . . G:6534
AGATATAAATATAAACAGGAAGATTTTAGACAGTATTTACGCCATACTGAAGAATATGAA C:60
R Y K Y K Q E D F R Q Y L R H T E E Y E P:20
. . . . . . G:6594
GTAGAGTTAATTCTGAGACTCTGTAAAGTGCCTTTGAATCCAGATGTTCTAGCTCATTTA C:60
V E L I L R L C K V P L N P D V L A H L P:20
. . . . . . G:6654
AATGTAATGGACAAAAATATTTTAGAGGATTGGCAACTTTCATTTGTACCTCCACCACCA C:60
N V M D K N I L E D W Q L S F V P P P P P:20
. . . . . . G:6714
CAAGGTATTGAAGATGCTTACAGATATATAATGTCTCAGGCAACAATGTGTCCAACAGAT C:60
Q G I E D A Y R Y I M S Q A T M C P T D P:20
. . . . . . G:6774
GTTCCTAATACTGAAAGGGAAGACCCTTATAAACAGTATACATTTTGGACAATAGATTTG C:60
V P N T E R E D P Y K Q Y T F W T I D L P:20
. . . . . . G:6834
CAAGAACGTTTTTCTAACGAATTATCCCAGTTTTCTCTTGGAAAAAGATATTTATATCAG C:60
Q E R F S N E L S Q F S L G K R Y L Y Q P:20
. . . . . . G:6894
TATGGCTTACTTAACGGACGAAAACGGTCTGCTAGTAGTTTTGTAACGAAGAAATCAAAA C:60
Y G L L N G R K R S A S S F V T K K S K P:20
. . G:6921
ACTGTGAAACGTAAAAGAACTAAATAA C:27
T V K R K R T K P:8
