HPV6 L1
Accession: H003219
NC: NP_040304.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 6
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:
ATGTGGCGGCCTAGCGACAGCACAGTATATGTGCCTCCTCCTAACCCTGTATCCAAAGTT C:60
M W R P S D S T V Y V P P P N P V S K V P:20
. . . . . . G:
GTTGCCACGGATGCTTATGTTACTCGCACCAACATATTTTATCATGCCAGCAGTTCTAGA C:60
V A T D A Y V T R T N I F Y H A S S S R P:20
. . . . . . G:
CTTCTTGCAGTGGGACATCCTTATTTTTCCATAAAACGGGCTAACAAAACTGTTGTGCCA C:60
L L A V G H P Y F S I K R A N K T V V P P:20
. . . . . . G:
AAGGTGTCAGGATATCAATACAGGGTATTTAAGGTGGTGTTACCAGATCCTAACAAATTT C:60
K V S G Y Q Y R V F K V V L P D P N K F P:20
. . . . . . G:
GCATTGCCTGACTCGTCTCTTTTCGATCCCACAACACAACGTTTAGTATGGGCATGCACA C:60
A L P D S S L F D P T T Q R L V W A C T P:20
. . . . . . G:
GGCCTAGAGGTGGGCAGGGGACAGCCATTAGGTGTGGGTGTAAGTGGACATCCTTTCCTA C:60
G L E V G R G Q P L G V G V S G H P F L P:20
. . . . . . G:
AATAAATATGATGATGTTGAAAATTCAGGGAGTGGTGGTAACCCTGGACAGGATAACAGG C:60
N K Y D D V E N S G S G G N P G Q D N R P:20
. . . . . . G:
GTTAATGTAGGTATGGATTATAAACAAACACAATTATGCATGGTTGGATGTGCCCCCCCT C:60
V N V G M D Y K Q T Q L C M V G C A P P P:20
. . . . . . G:
TTGGGCGAGCATTGGGGTAAAGGTAAACAGTGTACTAATACACCTGTACAGGCTGGTGAC C:60
L G E H W G K G K Q C T N T P V Q A G D P:20
. . . . . . G:
TGCCCGCCCTTAGAACTTATTACCAGTGTTATACAGGATGGCGATATGGTTGACACAGGC C:60
C P P L E L I T S V I Q D G D M V D T G P:20
. . . . . . G:
TTTGGTGCTATGAATTTTGCTGATTTGCAGACCAATAAATCAGATGTTCCTATTGACATA C:60
F G A M N F A D L Q T N K S D V P I D I P:20
. . . . . . G:
TGTGGCACTACATGTAAATATCCAGATTATTTACAAATGGCTGCAGACCCATATGGTGAT C:60
C G T T C K Y P D Y L Q M A A D P Y G D P:20
. . . . . . G:
AGATTATTTTTTTTTCTACGGAAGGAACAAATGTTTGCCAGACATTTTTTTAACAGGGCT C:60
R L F F F L R K E Q M F A R H F F N R A P:20
. . . . . . G:
GGCGAGGTGGGGGAACCTGTGCCTGATACACTTATAATTAAGGGTAGTGGAAATCGCACG C:60
G E V G E P V P D T L I I K G S G N R T P:20
. . . . . . G:
TCTGTAGGGAGTAGTATATATGTTAACACCCCGAGCGGCTCTTTGGTGTCCTCTGAGGCA C:60
S V G S S I Y V N T P S G S L V S S E A P:20
. . . . . . G:
CAATTGTTTAATAAGCCATATTGGCTACAAAAAGCCCAGGGACATAACAATGGTATTTGT C:60
Q L F N K P Y W L Q K A Q G H N N G I C P:20
. . . . . . G:
TGGGGTAATCAACTGTTTGTTACTGTGGTAGATACCACACGCAGTACCAACATGACATTA C:60
W G N Q L F V T V V D T T R S T N M T L P:20
. . . . . . G:
TGTGCATCCGTAACTACATCTTCCACATACACCAATTCTGATTATAAAGAGTACATGCGT C:60
C A S V T T S S T Y T N S D Y K E Y M R P:20
. . . . . . G:
CATGTGGAAGAGTATGATTTACAATTTATTTTTCAATTATGTAGCATTACATTGTCTGCT C:60
H V E E Y D L Q F I F Q L C S I T L S A P:20
. . . . . . G:
GAAGTAATGGCCTATATTCACACAATGAATCCCTCTGTTTTGGAAGACTGGAACTTTGGG C:60
E V M A Y I H T M N P S V L E D W N F G P:20
. . . . . . G:
TTATCGCCTCCCCCAAATGGTACATTAGAAGATACCTATAGGTATGTGCAGTCACAGGCC C:60
L S P P P N G T L E D T Y R Y V Q S Q A P:20
. . . . . . G:
ATTACCTGTCAAAAGCCCACTCCTGAAAAGGAAAAGCCAGATCCCTATAAGAACCTTAGT C:60
I T C Q K P T P E K E K P D P Y K N L S P:20
. . . . . . G:
TTTTGGGAGGTTAATTTAAAAGAAAAGTTTTCTAGTGAATTGGATCAGTATCCTTTGGGA C:60
F W E V N L K E K F S S E L D Q Y P L G P:20
. . . . . . G:
CGCAAGTTTTTGTTACAAAGTGGATATAGGGGACGGTCCTCTATTCGTACAGGTGTTAAG C:60
R K F L L Q S G Y R G R S S I R T G V K P:20
. . . . . . G:
CGCCCTGCTGTTTCCAAAGCCTCTGCTGCCCCTAAACGTAAGCGCGCCAAAACTAAAAGG C:60
R P A V S K A S A A P K R K R A K T K R P:20
G:
TAA C:3
P:0
