HPV6 L1

Accession: H003219
NC: NP_040304.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 6

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:
ATGTGGCGGCCTAGCGACAGCACAGTATATGTGCCTCCTCCTAACCCTGTATCCAAAGTT     C:60
M W R P S D S T V Y V P P P N P V S K V      P:20


. . . . . .     G:
GTTGCCACGGATGCTTATGTTACTCGCACCAACATATTTTATCATGCCAGCAGTTCTAGA     C:60
V A T D A Y V T R T N I F Y H A S S S R      P:20


. . . . . .     G:
CTTCTTGCAGTGGGACATCCTTATTTTTCCATAAAACGGGCTAACAAAACTGTTGTGCCA     C:60
L L A V G H P Y F S I K R A N K T V V P      P:20


. . . . . .     G:
AAGGTGTCAGGATATCAATACAGGGTATTTAAGGTGGTGTTACCAGATCCTAACAAATTT     C:60
K V S G Y Q Y R V F K V V L P D P N K F      P:20


. . . . . .     G:
GCATTGCCTGACTCGTCTCTTTTCGATCCCACAACACAACGTTTAGTATGGGCATGCACA     C:60
A L P D S S L F D P T T Q R L V W A C T      P:20


. . . . . .     G:
GGCCTAGAGGTGGGCAGGGGACAGCCATTAGGTGTGGGTGTAAGTGGACATCCTTTCCTA     C:60
G L E V G R G Q P L G V G V S G H P F L      P:20


. . . . . .     G:
AATAAATATGATGATGTTGAAAATTCAGGGAGTGGTGGTAACCCTGGACAGGATAACAGG     C:60
N K Y D D V E N S G S G G N P G Q D N R      P:20


. . . . . .     G:
GTTAATGTAGGTATGGATTATAAACAAACACAATTATGCATGGTTGGATGTGCCCCCCCT     C:60
V N V G M D Y K Q T Q L C M V G C A P P      P:20


. . . . . .     G:
TTGGGCGAGCATTGGGGTAAAGGTAAACAGTGTACTAATACACCTGTACAGGCTGGTGAC     C:60
L G E H W G K G K Q C T N T P V Q A G D      P:20


. . . . . .     G:
TGCCCGCCCTTAGAACTTATTACCAGTGTTATACAGGATGGCGATATGGTTGACACAGGC     C:60
C P P L E L I T S V I Q D G D M V D T G      P:20


. . . . . .     G:
TTTGGTGCTATGAATTTTGCTGATTTGCAGACCAATAAATCAGATGTTCCTATTGACATA     C:60
F G A M N F A D L Q T N K S D V P I D I      P:20


. . . . . .     G:
TGTGGCACTACATGTAAATATCCAGATTATTTACAAATGGCTGCAGACCCATATGGTGAT     C:60
C G T T C K Y P D Y L Q M A A D P Y G D      P:20


. . . . . .     G:
AGATTATTTTTTTTTCTACGGAAGGAACAAATGTTTGCCAGACATTTTTTTAACAGGGCT     C:60
R L F F F L R K E Q M F A R H F F N R A      P:20


. . . . . .     G:
GGCGAGGTGGGGGAACCTGTGCCTGATACACTTATAATTAAGGGTAGTGGAAATCGCACG     C:60
G E V G E P V P D T L I I K G S G N R T      P:20


. . . . . .     G:
TCTGTAGGGAGTAGTATATATGTTAACACCCCGAGCGGCTCTTTGGTGTCCTCTGAGGCA     C:60
S V G S S I Y V N T P S G S L V S S E A      P:20


. . . . . .     G:
CAATTGTTTAATAAGCCATATTGGCTACAAAAAGCCCAGGGACATAACAATGGTATTTGT     C:60
Q L F N K P Y W L Q K A Q G H N N G I C      P:20


. . . . . .     G:
TGGGGTAATCAACTGTTTGTTACTGTGGTAGATACCACACGCAGTACCAACATGACATTA     C:60
W G N Q L F V T V V D T T R S T N M T L      P:20


. . . . . .     G:
TGTGCATCCGTAACTACATCTTCCACATACACCAATTCTGATTATAAAGAGTACATGCGT     C:60
C A S V T T S S T Y T N S D Y K E Y M R      P:20


. . . . . .     G:
CATGTGGAAGAGTATGATTTACAATTTATTTTTCAATTATGTAGCATTACATTGTCTGCT     C:60
H V E E Y D L Q F I F Q L C S I T L S A      P:20


. . . . . .     G:
GAAGTAATGGCCTATATTCACACAATGAATCCCTCTGTTTTGGAAGACTGGAACTTTGGG     C:60
E V M A Y I H T M N P S V L E D W N F G      P:20


. . . . . .     G:
TTATCGCCTCCCCCAAATGGTACATTAGAAGATACCTATAGGTATGTGCAGTCACAGGCC     C:60
L S P P P N G T L E D T Y R Y V Q S Q A      P:20


. . . . . .     G:
ATTACCTGTCAAAAGCCCACTCCTGAAAAGGAAAAGCCAGATCCCTATAAGAACCTTAGT     C:60
I T C Q K P T P E K E K P D P Y K N L S      P:20


. . . . . .     G:
TTTTGGGAGGTTAATTTAAAAGAAAAGTTTTCTAGTGAATTGGATCAGTATCCTTTGGGA     C:60
F W E V N L K E K F S S E L D Q Y P L G      P:20


. . . . . .     G:
CGCAAGTTTTTGTTACAAAGTGGATATAGGGGACGGTCCTCTATTCGTACAGGTGTTAAG     C:60
R K F L L Q S G Y R G R S S I R T G V K      P:20


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CGCCCTGCTGTTTCCAAAGCCTCTGCTGCCCCTAAACGTAAGCGCGCCAAAACTAAAAGG     C:60
R P A V S K A S A A P K R K R A K T K R      P:20


     G:
TAA      C:3
     P:0