HPV136 L1
Accession: H003210
NC: YP_006393294.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 13
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:
ATGGCCACTTGGAGTTCGAATGCAGGAAGATTATATTTGCCTCCTGTGAAGCCAGTAGCA C:60
M A T W S S N A G R L Y L P P V K P V A P:20
. . . . . . G:
AGGATTTTATCAACAGATGAATATATTAAGCCAACATCTTATTTTTTTCATGCTAGTACG C:60
R I L S T D E Y I K P T S Y F F H A S T P:20
. . . . . . G:
GATAGACTTTTAACTGTTGGCCATCCATATTTTGATATAGTGGATAATCGCCAAAAAGTG C:60
D R L L T V G H P Y F D I V D N R Q K V P:20
. . . . . . G:
ACAGTTCCAAAGGTTTCTGCAAACCAATTTAGAGTGTTACGTTTACAATTACCTGATCCT C:60
T V P K V S A N Q F R V L R L Q L P D P P:20
. . . . . . G:
AATCAATTTGCTCTAATTGATTCTACAGTGTATAATCCAGAGAGAGAACGATTAGTATGG C:60
N Q F A L I D S T V Y N P E R E R L V W P:20
. . . . . . G:
CAATTGAAGGGAGTTCAGATAGATAGAGGTGGTCCTCTAGGCGTAGGGACAACAGGGCAC C:60
Q L K G V Q I D R G G P L G V G T T G H P:20
. . . . . . G:
CCGTTATTTGATAAATTTGGTGACACTGAAAACCCTAGTGTTTATCCTGATGTCACAGCA C:60
P L F D K F G D T E N P S V Y P D V T A P:20
. . . . . . G:
AGCAAGGAAAACAGAATGAATGTTTCTTTTGATCCTAAACAAAATCAATTATTTATAGTA C:60
S K E N R M N V S F D P K Q N Q L F I V P:20
. . . . . . G:
GGCTGTAAACCAGCTATAGGACAGCATTGGGATATTGCTGATCCTTGTACGCCACCTGTA C:60
G C K P A I G Q H W D I A D P C T P P V P:20
. . . . . . G:
GATAAAGGCTTATGTCCACCTATTAGGTTAGTACACACAACTATTCAGGATGGAGATATG C:60
D K G L C P P I R L V H T T I Q D G D M P:20
. . . . . . G:
TGCGATATAGGTCTGGGCGCTGCAAACTTTTCAGCATTTTCAGAAAGTAGAGCAGACGCT C:60
C D I G L G A A N F S A F S E S R A D A P:20
. . . . . . G:
CCTTTAGAGATTATTAACTCCACTTGTAAATGGCCTGATTTTACTCAAATGACAAAAGAT C:60
P L E I I N S T C K W P D F T Q M T K D P:20
. . . . . . G:
ATTTATGGGGACAGATTGTTTTTTTATGGTCGCAGAGAACAAGTGTATGCTAGACATTAT C:60
I Y G D R L F F Y G R R E Q V Y A R H Y P:20
. . . . . . G:
TTTTGTAAAGATGGAGTTGTTGGTGATAGCATTCCAGATGGCGTAGAACCTAATGAGCAT C:60
F C K D G V V G D S I P D G V E P N E H P:20
. . . . . . G:
GGCAGGTTCTTTTTATCACCTGACAATGCTACACCTCCAGATAAAGGCTTAGCCCCTTCG C:60
G R F F L S P D N A T P P D K G L A P S P:20
. . . . . . G:
ACGTATTATCCGACGCCCAGTGGTTCGTTAGTTAGCAGCGAATCTCAAATATTTAATAGG C:60
T Y Y P T P S G S L V S S E S Q I F N R P:20
. . . . . . G:
CCATTTTGGGTACATAAAGCTCAGGGAAGCAATAATGCTATCCTTTGGGGAAATGAACTA C:60
P F W V H K A Q G S N N A I L W G N E L P:20
. . . . . . G:
TTTATTACTATAGTGGATAATACTCGCAACACTAATTTTATATTGTCTGTATACAAGGAA C:60
F I T I V D N T R N T N F I L S V Y K E P:20
. . . . . . G:
GATAATCCTATTGATAATCAATATAAATATAAATCAGACAACTTCAGACATTATATGAGA C:60
D N P I D N Q Y K Y K S D N F R H Y M R P:20
. . . . . . G:
CATACCGAGGAGTTTGAAGTGGAGCTTGTGACTCAATTGTGTAAAGTTCCTCTGGAAGCT C:60
H T E E F E V E L V T Q L C K V P L E A P:20
. . . . . . G:
GATGTGCTAGCCCACATTAATGCAATGGACTCTCGCATCTTAGATGACTGGGAGTTAGCA C:60
D V L A H I N A M D S R I L D D W E L A P:20
. . . . . . G:
TTTATTCCTTCACCTCCTCAGGGCTTGGAGGATTCGTATAGATTTATTAGATCATTAGCC C:60
F I P S P P Q G L E D S Y R F I R S L A P:20
. . . . . . G:
ACTATGTGTCCTAAGGATGTTCCTAAACCAGACAAAGAAGATCCTTACAAGGATTTAACA C:60
T M C P K D V P K P D K E D P Y K D L T P:20
. . . . . . G:
TTTTGGAAGGTGGATTTGCGAGATAAATTTACCTCCGAGCTTGATCAGACACCATTAGGC C:60
F W K V D L R D K F T S E L D Q T P L G P:20
. . . . . . G:
AAAAAATTCTTATATCAGATGGGATTACTTAATTCCCGTAAGCGACCACGGAATATCTAT C:60
K K F L Y Q M G L L N S R K R P R N I Y P:20
. . . . . . G:
GAACCAACAACTCCTTCTACTGTGAAGCGTCGCACTACTAAACGACGCCGTGTTACCAGA C:60
E P T T P S T V K R R T T K R R R V T R P:20
. G:
GCAGTCTCATAA C:12
A V S P:3
