HPV34 L1

Accession: H003185
NC: NP_041812.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 34

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5489
ATGGGTCCGATTTTATATTGCATCCTAGCTTGTATGTCATTCCACGCAAACGTAAACGTT     C:60
M G P I L Y C I L A C M S F H A N V N V      P:20


. . . . . .     G:5549
TGTCATATTTTTTTGCAGATGTGGCGACCTACTGAGGCAAAGGTATACCTGCCCCCTGTG     C:60
C H I F L Q M W R P T E A K V Y L P P V      P:20


. . . . . .     G:5609
TCTGTATCTAAAGTTGTAAGCACTGAAGAGTATGTAACACGCACAAATATATATTATTAT     C:60
S V S K V V S T E E Y V T R T N I Y Y Y      P:20


. . . . . .     G:5669
GCAGGTAGTACACGCTTGCTGGCAGTAGGACATCCCTATTATCCTATAAAGGATACTAAT     C:60
A G S T R L L A V G H P Y Y P I K D T N      P:20


. . . . . .     G:5729
GGGAAACGTAAGATTGCTGTACCTAAAGTTTCAGGTTTGCAATACAGGGTATTTAGAATA     C:60
G K R K I A V P K V S G L Q Y R V F R I      P:20


. . . . . .     G:5789
CGTTTGCCAGATCCCAATAAATTTGGGTTCCCAGATGCATCTTTTTATAATCCTGACAAG     C:60
R L P D P N K F G F P D A S F Y N P D K      P:20


. . . . . .     G:5849
GAGCGGTTGGTTTGGGCCTGTGCAGGCGTTGAGGTTGGACGCGGACAGCCATTAGGTATA     C:60
E R L V W A C A G V E V G R G Q P L G I      P:20


. . . . . .     G:5909
GGTACTAGTGGTAATCCTTTTATGAATAAACTTGAGGATACTGAAAATGCTGCAAAATAT     C:60
G T S G N P F M N K L E D T E N A A K Y      P:20


. . . . . .     G:5969
ATTGGTGGAAACATAGCAGATAGTAGGGAGTGTATGTCAGTAGATTATAAACAAACACAG     C:60
I G G N I A D S R E C M S V D Y K Q T Q      P:20


. . . . . .     G:6029
TTATGTATTGTAGGCTGTAAGCCTCCCTTAGGGGAACATTGGGGTACAGGCACACCATGT     C:60
L C I V G C K P P L G E H W G T G T P C      P:20


. . . . . .     G:6089
GGTACCCAAAATGCTGGGGAATGTCCTCCGCTTGAATTAAAGAACACCACTATACAGGAT     C:60
G T Q N A G E C P P L E L K N T T I Q D      P:20


. . . . . .     G:6149
GGTGATATGATTGATGTGGGCTTTGGTGCCATGGATTTTAAGGCCTTACAGGCAAATAAA     C:60
G D M I D V G F G A M D F K A L Q A N K      P:20


. . . . . .     G:6209
AGTGATGTGCCCATTGATATTTCCAACACTATATGTAAATATCCAGATTATCTAGGCATG     C:60
S D V P I D I S N T I C K Y P D Y L G M      P:20


. . . . . .     G:6269
GCCGCAGATCCCTATGGCGATTCTATGTGGTTTTATATTCGTAGGGAACAAATGTTTGTT     C:60
A A D P Y G D S M W F Y I R R E Q M F V      P:20


. . . . . .     G:6329
AGACACCTATTTAACAGGGCAGGTACTGTAGGCGATGCTATTCCAGATGACTTAATGATT     C:60
R H L F N R A G T V G D A I P D D L M I      P:20


. . . . . .     G:6389
AAGGGTACAGGCAATACTGCATCGCCATCCAGTTGTGTGTTTTATCCTACTCCTAGTGGG     C:60
K G T G N T A S P S S C V F Y P T P S G      P:20


. . . . . .     G:6449
TCTATGGTATCCTCAGATGCACAAATTTTTAATAAGCCTTATTGGTTGCAAAAGGCCCAG     C:60
S M V S S D A Q I F N K P Y W L Q K A Q      P:20


. . . . . .     G:6509
GGACAAAACAATGGCATTTGCTGGCATAATCAACTGTTTTTAACTGTTGTAGATACTACT     C:60
G Q N N G I C W H N Q L F L T V V D T T      P:20


. . . . . .     G:6569
AGAAGCACAAACTTTTCAGTTTGTGTAGGTACACAATCCACAAGTACAACTGCACCATAT     C:60
R S T N F S V C V G T Q S T S T T A P Y      P:20


. . . . . .     G:6629
GCAAACAGTAATTTTAAGGAATACCTCAGACATGCAGAAGAGTATGACCTGCAGTTTGTG     C:60
A N S N F K E Y L R H A E E Y D L Q F V      P:20


. . . . . .     G:6689
TTTCAGTTATGCAAAATCAATTTAACTACAGATGTAATGACATATATACATTCTATGAGT     C:60
F Q L C K I N L T T D V M T Y I H S M S      P:20


. . . . . .     G:6749
TCTAGTATATTGGAACAGTGGAATTTTGGTCTTACACCACCGCCTTCAGGTACTTTAGAA     C:60
S S I L E Q W N F G L T P P P S G T L E      P:20


. . . . . .     G:6809
GAAACATATAGATATGTTACTTCACAGGCCATTACATGTCAGCGTCCGCAACCTCCTAAG     C:60
E T Y R Y V T S Q A I T C Q R P Q P P K      P:20


. . . . . .     G:6869
GAAACAGAGGACCCATATGGTAAAATGACATTTTGGGAGGTAGACCTTAAAGAAAAATTT     C:60
E T E D P Y G K M T F W E V D L K E K F      P:20


. . . . . .     G:6929
TCTGCAGAATTAGATCAGTTTGCCTTAGGTAGAAAGTTTTTATTACAACTAGGTATGCGT     C:60
S A E L D Q F A L G R K F L L Q L G M R      P:20


. . . . . .     G:6989
GCCCGTCCTAGGTTACAGGCCTCTAAACGGTCTGCACCTTCATCATCTAGTACAGCACCT     C:60
A R P R L Q A S K R S A P S S S S T A P      P:20


. .      G:7016
AAGAAAAAACGTGCAAAACGTATTTAA      C:27
K K K R A K R I      P:8