HPV88 L1

Accession: H003127
NC: YP_001672014.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 88

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5369
ATGGCATTATGGCAACAACAAACTGGGAAGCTGTTCCTTCCGCCGGCTAAACCTGTGGCA     C:60
M A L W Q Q Q T G K L F L P P A K P V A      P:20


. . . . . .     G:5429
AAAATATTATCTACAGATGATTATGTTATTGGAACTCAGTTACATTTTCATGCTGGCACT     C:60
K I L S T D D Y V I G T Q L H F H A G T      P:20


. . . . . .     G:5489
GATCGTCTGTTAACAGTAGACCATCCCTACTATGAAATTAGGAATGATGGAGATCCCAAC     C:60
D R L L T V D H P Y Y E I R N D G D P N      P:20


. . . . . .     G:5549
AAAATTGAGATTCCTAAGGTGTCTGCATGCCAATATCGAGTGTTTAGGCTGAAATTGCCT     C:60
K I E I P K V S A C Q Y R V F R L K L P      P:20


. . . . . .     G:5609
GATCCAAATAAATTTGCCTTAATAGATCAGTCAATTTTCAATCCTGAACGTGAACGTTTA     C:60
D P N K F A L I D Q S I F N P E R E R L      P:20


. . . . . .     G:5669
GTTTGGAAATTAAAAGGTATTCAAATTGGTAGAGGTGGACCACTAAATGTAGGTACTGCA     C:60
V W K L K G I Q I G R G G P L N V G T A      P:20


. . . . . .     G:5729
GGTCATCCTTTATTTAACAAAGCTCCAGATACTGAAAATCCTAATGATTATCCACCAGCT     C:60
G H P L F N K A P D T E N P N D Y P P A      P:20


. . . . . .     G:5789
CAAACAGATGAAGACAGACGTAACGTGTCTATGGACCCCAAACATACCCAATTATTTATA     C:60
Q T D E D R R N V S M D P K H T Q L F I      P:20


. . . . . .     G:5849
ATTGGTTGCATTCCTGCAGATGGTGAATATTGGGATGTTGCTAAACCATGTGTTGGAGAT     C:60
I G C I P A D G E Y W D V A K P C V G D      P:20


. . . . . .     G:5909
CAGGCGAATGCAGGAGACTGTCCACCTATACAGTTAGTTAATGCTGTTATTCAGGACGGA     C:60
Q A N A G D C P P I Q L V N A V I Q D G      P:20


. . . . . .     G:5969
ACAATGGGTGACACAGGTTTTGGGGCAGCAAATTTTAAGAACTTTTTGCAAGACAAAGCA     C:60
T M G D T G F G A A N F K N F L Q D K A      P:20


. . . . . .     G:6029
GGTGTTCCTCTGGATATTATTAATGATATATGTATGTATCCAGACTTCCTTAAAATGGAC     C:60
G V P L D I I N D I C M Y P D F L K M D      P:20


. . . . . .     G:6089
AAAGATGTTTATGGCGATAAATGTTTCTTTTTTGGAAAACGTGAGCAGTCGTATGCTCGC     C:60
K D V Y G D K C F F F G K R E Q S Y A R      P:20


. . . . . .     G:6149
CATTTTATGGCTCGTGAAGGTAAAATGGGAGATGCCATACCAGAGGGAAATAAATACTTA     C:60
H F M A R E G K M G D A I P E G N K Y L      P:20


. . . . . .     G:6209
TTGCCACCTACAAATGCTGTGAATTTTAAAATGGGATCTCATGTTTATTTCCCTACTGCT     C:60
L P P T N A V N F K M G S H V Y F P T A      P:20


. . . . . .     G:6269
AGTGGATCACTTACTACTAGTGATTCTAACTTATTTAACAGACCTTATTGGCTACAGAGA     C:60
S G S L T T S D S N L F N R P Y W L Q R      P:20


. . . . . .     G:6329
TCTTTAGGTGCAAATAATGGAATATGTTGGGGGAATCAGTTATTTGTTACTGTTCTTGAT     C:60
S L G A N N G I C W G N Q L F V T V L D      P:20


. . . . . .     G:6389
AACAGCAGGAATACTAATTTTACTCTTTCCATTTATAATCAGGGAGGAGCTATTGGAAAT     C:60
N S R N T N F T L S I Y N Q G G A I G N      P:20


. . . . . .     G:6449
CAGTATACTTATAAATCTCAAGATTTTACTCAGTATACTCGACATGCAGAGGAATACGAA     C:60
Q Y T Y K S Q D F T Q Y T R H A E E Y E      P:20


. . . . . .     G:6509
TTGGAAGCTATATTCCAGCTTTGTAGAGTTCCTTTGGAGCCTGATATTTTAGCTCACTTA     C:60
L E A I F Q L C R V P L E P D I L A H L      P:20


. . . . . .     G:6569
AATGTTATGAATCCTAATATATTAGATGAATGGCAATTAGCTTTTGTGCCTCCTCCTCCT     C:60
N V M N P N I L D E W Q L A F V P P P P      P:20


. . . . . .     G:6629
CAGAGTATAGAGGACAATTATAGATATATAACATCTTTGGCAACAAGATGTCCTACTGAA     C:60
Q S I E D N Y R Y I T S L A T R C P T E      P:20


. . . . . .     G:6689
AATCCTGCTCCAGAAATACCTGACCCTTATAAAGATTATAATTTTTGGTTAGTTGATTTG     C:60
N P A P E I P D P Y K D Y N F W L V D L      P:20


. . . . . .     G:6749
CAAGAGAAGTTCTCCAGTGAACTTGACCAATTTAGCTTAGGTCGCAAATTTTTGTTTCAA     C:60
Q E K F S S E L D Q F S L G R K F L F Q      P:20


. . . . . .     G:6809
AGTGGTTTGCTGCCCACAAAACGTGTCAGGACAGTTGCCAATAGTTCTGTTAGAAATACT     C:60
S G L L P T K R V R T V A N S S V R N T      P:20


. . .      G:6842
TCCAGAACAGTAAAAAGAAAACGAACACGATAA      C:33
S R T V K R K R T R      P:10