HPV96 L1
Accession: H003118
NC: NP_932325.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 96
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5915
ATGTCATCATTGTGGTTGTCAACAACGGGTAAGGTCTATTTACCACCATCAACACCAGTT C:60
M S S L W L S T T G K V Y L P P S T P V P:20
. . . . . . G:5975
GCCAGGGTGCAAAGCACGGACTCCTACATACAAAGAACAAACATCTATTATCATGCTAAT C:60
A R V Q S T D S Y I Q R T N I Y Y H A N P:20
. . . . . . G:6035
ACTGACCGCCTGTTAACAGTAGGACATCCTTATTTTGATGTGAGGAAAAATAATGGAGAT C:60
T D R L L T V G H P Y F D V R K N N G D P:20
. . . . . . G:6095
CATGAAGTGTTAGTTCCCAAGGTGTCAGGTAATCAGTACAGGGCCTTTAGGGTACACTTA C:60
H E V L V P K V S G N Q Y R A F R V H L P:20
. . . . . . G:6155
CCGGATCCTAACAGATTTGCTCTAGCTGACATGTCAGTGGTAAATCCTGATAGGGAGCGT C:60
P D P N R F A L A D M S V V N P D R E R P:20
. . . . . . G:6215
TTGGTATGGGCTGTTAGAGGAATGGAAATTGGTCGTGGACAGCCATTAGGTGTAGGTACA C:60
L V W A V R G M E I G R G Q P L G V G T P:20
. . . . . . G:6275
TCAGGACATCCATTATTTAACAAGGTGAAAGACACGGAAAATCCAAATGGCTATAATACA C:60
S G H P L F N K V K D T E N P N G Y N T P:20
. . . . . . G:6335
GGTGGAAAGGATGATAGGGTGAATACATCCTTTGATCCCAAACAAATTCAAATGTTTGTT C:60
G G K D D R V N T S F D P K Q I Q M F V P:20
. . . . . . G:6395
TTGGGTTGTATACCCTGCTTGGGGGAACATTGGGACAAGGCCTTACCTTGTGTAGAAAAT C:60
L G C I P C L G E H W D K A L P C V E N P:20
. . . . . . G:6455
CCTCCTGATCAGGGAGCGTGTCCACCTCTAGAATTAAAAAATACTATTATTGAAGATGGG C:60
P P D Q G A C P P L E L K N T I I E D G P:20
. . . . . . G:6515
GACATGGGAGACATAGGGTTTGGAAATCTTAATTTTAAAACATTATCAGTCACTAAGTCT C:60
D M G D I G F G N L N F K T L S V T K S P:20
. . . . . . G:6575
GATGTTAGTCTGGATATTGTTAATGAAATTTGCAAGTATCCAGATTTCTTAAAAATGGCT C:60
D V S L D I V N E I C K Y P D F L K M A P:20
. . . . . . G:6635
AATGATGTGTATGGCAATGCTTGCTTCTTTTATGCCAGAAGAGAACAATGTTATGCCAGA C:60
N D V Y G N A C F F Y A R R E Q C Y A R P:20
. . . . . . G:6695
CATATGTTTTGTAGAGGTGGGTCAGTAGGAGACAGTATTCCAGATGATGCAGTTGGAGAA C:60
H M F C R G G S V G D S I P D D A V G E P:20
. . . . . . G:6755
GACAACCATTATTATTTAAAGGCTGCCAGTGATCAAAACAGAGATACAATGGCAAGTTCC C:60
D N H Y Y L K A A S D Q N R D T M A S S P:20
. . . . . . G:6815
ATTTACACTCCCACAGTCAGTGGATCTTTAGTTTCTACAGATGCACAGATTTTCAATAGG C:60
I Y T P T V S G S L V S T D A Q I F N R P:20
. . . . . . G:6875
CCTTTTTGGCTGCAAAGGGCTCAAGGCCATAATAATGGTATTTGCTGGGGTAATCAAATC C:60
P F W L Q R A Q G H N N G I C W G N Q I P:20
. . . . . . G:6935
TTTCTCACAGTAATAGATAATACCAGGAATACTAATTTCTGTATCAGTGTCTCCTCAAAT C:60
F L T V I D N T R N T N F C I S V S S N P:20
. . . . . . G:6995
GATCAGGCATTACAGGAATACAATACTGCAAACTTTAGAGAATATTTGAGACATGTAGAA C:60
D Q A L Q E Y N T A N F R E Y L R H V E P:20
. . . . . . G:7055
GAGTATGAATTATCCTTTATATTACAATTATGTAAAGTTCCATTAGAGCCAGAAGTATTA C:60
E Y E L S F I L Q L C K V P L E P E V L P:20
. . . . . . G:7115
GCACAAATTAATGCTATGAATGCAGACATTTTAGAAGATTGGCAATTAGGTTTTGTTCCT C:60
A Q I N A M N A D I L E D W Q L G F V P P:20
. . . . . . G:7175
TCTCCTGACAATCCCATCAATGATACATATAGATACATACATTCAGCAGCCACACGGTGT C:60
S P D N P I N D T Y R Y I H S A A T R C P:20
. . . . . . G:7235
CCAGATAAAACTACACCTAAAGAAAAAGCAGATCCCTTTGCAGGTTATCACTTTTGGGAT C:60
P D K T T P K E K A D P F A G Y H F W D P:20
. . . . . . G:7295
GTTGATTTGTCTGAAAAGTTATCATTAGATTTAGATCAGTATTCTCTGGGACGTAAATTC C:60
V D L S E K L S L D L D Q Y S L G R K F P:20
. . . . . . G:7355
TTATTTCAAGCCAACCTGCAAAACAAAAGAGTTAACAGAGGGGTTACTGTAACCGGGAGG C:60
L F Q A N L Q N K R V N R G V T V T G R P:20
. . . G:7394
GCTACAACCTCAAGAGGTACAAAACGAAAACGACGCTGA C:39
A T T S R G T K R K R R P:12
