HPV96 L1

Accession: H003118
NC: NP_932325.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 96

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5915
ATGTCATCATTGTGGTTGTCAACAACGGGTAAGGTCTATTTACCACCATCAACACCAGTT     C:60
M S S L W L S T T G K V Y L P P S T P V      P:20


. . . . . .     G:5975
GCCAGGGTGCAAAGCACGGACTCCTACATACAAAGAACAAACATCTATTATCATGCTAAT     C:60
A R V Q S T D S Y I Q R T N I Y Y H A N      P:20


. . . . . .     G:6035
ACTGACCGCCTGTTAACAGTAGGACATCCTTATTTTGATGTGAGGAAAAATAATGGAGAT     C:60
T D R L L T V G H P Y F D V R K N N G D      P:20


. . . . . .     G:6095
CATGAAGTGTTAGTTCCCAAGGTGTCAGGTAATCAGTACAGGGCCTTTAGGGTACACTTA     C:60
H E V L V P K V S G N Q Y R A F R V H L      P:20


. . . . . .     G:6155
CCGGATCCTAACAGATTTGCTCTAGCTGACATGTCAGTGGTAAATCCTGATAGGGAGCGT     C:60
P D P N R F A L A D M S V V N P D R E R      P:20


. . . . . .     G:6215
TTGGTATGGGCTGTTAGAGGAATGGAAATTGGTCGTGGACAGCCATTAGGTGTAGGTACA     C:60
L V W A V R G M E I G R G Q P L G V G T      P:20


. . . . . .     G:6275
TCAGGACATCCATTATTTAACAAGGTGAAAGACACGGAAAATCCAAATGGCTATAATACA     C:60
S G H P L F N K V K D T E N P N G Y N T      P:20


. . . . . .     G:6335
GGTGGAAAGGATGATAGGGTGAATACATCCTTTGATCCCAAACAAATTCAAATGTTTGTT     C:60
G G K D D R V N T S F D P K Q I Q M F V      P:20


. . . . . .     G:6395
TTGGGTTGTATACCCTGCTTGGGGGAACATTGGGACAAGGCCTTACCTTGTGTAGAAAAT     C:60
L G C I P C L G E H W D K A L P C V E N      P:20


. . . . . .     G:6455
CCTCCTGATCAGGGAGCGTGTCCACCTCTAGAATTAAAAAATACTATTATTGAAGATGGG     C:60
P P D Q G A C P P L E L K N T I I E D G      P:20


. . . . . .     G:6515
GACATGGGAGACATAGGGTTTGGAAATCTTAATTTTAAAACATTATCAGTCACTAAGTCT     C:60
D M G D I G F G N L N F K T L S V T K S      P:20


. . . . . .     G:6575
GATGTTAGTCTGGATATTGTTAATGAAATTTGCAAGTATCCAGATTTCTTAAAAATGGCT     C:60
D V S L D I V N E I C K Y P D F L K M A      P:20


. . . . . .     G:6635
AATGATGTGTATGGCAATGCTTGCTTCTTTTATGCCAGAAGAGAACAATGTTATGCCAGA     C:60
N D V Y G N A C F F Y A R R E Q C Y A R      P:20


. . . . . .     G:6695
CATATGTTTTGTAGAGGTGGGTCAGTAGGAGACAGTATTCCAGATGATGCAGTTGGAGAA     C:60
H M F C R G G S V G D S I P D D A V G E      P:20


. . . . . .     G:6755
GACAACCATTATTATTTAAAGGCTGCCAGTGATCAAAACAGAGATACAATGGCAAGTTCC     C:60
D N H Y Y L K A A S D Q N R D T M A S S      P:20


. . . . . .     G:6815
ATTTACACTCCCACAGTCAGTGGATCTTTAGTTTCTACAGATGCACAGATTTTCAATAGG     C:60
I Y T P T V S G S L V S T D A Q I F N R      P:20


. . . . . .     G:6875
CCTTTTTGGCTGCAAAGGGCTCAAGGCCATAATAATGGTATTTGCTGGGGTAATCAAATC     C:60
P F W L Q R A Q G H N N G I C W G N Q I      P:20


. . . . . .     G:6935
TTTCTCACAGTAATAGATAATACCAGGAATACTAATTTCTGTATCAGTGTCTCCTCAAAT     C:60
F L T V I D N T R N T N F C I S V S S N      P:20


. . . . . .     G:6995
GATCAGGCATTACAGGAATACAATACTGCAAACTTTAGAGAATATTTGAGACATGTAGAA     C:60
D Q A L Q E Y N T A N F R E Y L R H V E      P:20


. . . . . .     G:7055
GAGTATGAATTATCCTTTATATTACAATTATGTAAAGTTCCATTAGAGCCAGAAGTATTA     C:60
E Y E L S F I L Q L C K V P L E P E V L      P:20


. . . . . .     G:7115
GCACAAATTAATGCTATGAATGCAGACATTTTAGAAGATTGGCAATTAGGTTTTGTTCCT     C:60
A Q I N A M N A D I L E D W Q L G F V P      P:20


. . . . . .     G:7175
TCTCCTGACAATCCCATCAATGATACATATAGATACATACATTCAGCAGCCACACGGTGT     C:60
S P D N P I N D T Y R Y I H S A A T R C      P:20


. . . . . .     G:7235
CCAGATAAAACTACACCTAAAGAAAAAGCAGATCCCTTTGCAGGTTATCACTTTTGGGAT     C:60
P D K T T P K E K A D P F A G Y H F W D      P:20


. . . . . .     G:7295
GTTGATTTGTCTGAAAAGTTATCATTAGATTTAGATCAGTATTCTCTGGGACGTAAATTC     C:60
V D L S E K L S L D L D Q Y S L G R K F      P:20


. . . . . .     G:7355
TTATTTCAAGCCAACCTGCAAAACAAAAGAGTTAACAGAGGGGTTACTGTAACCGGGAGG     C:60
L F Q A N L Q N K R V N R G V T V T G R      P:20


. . .      G:7394
GCTACAACCTCAAGAGGTACAAAACGAAAACGACGCTGA      C:39
A T T S R G T K R K R R      P:12