HPV4 L1
Accession: H003097
NC: NP_040895.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 4
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5404
ATGTCGAGTTGGTTATCTACAACGGGTAAAGTCTACTTACCTCCAGCTCAACCTGTGGCA C:60
M S S W L S T T G K V Y L P P A Q P V A P:20
. . . . . . G:5464
AGAGTTTTGGAAACTGACGAATATATCACTGGAACATCTCTGTATTTCCACGCTGGTACA C:60
R V L E T D E Y I T G T S L Y F H A G T P:20
. . . . . . G:5524
GAAAGGCTTTTAACTGTAGGCCATCCTTATTTTCCAGTGAAAGATGTACAGGAACCTCAC C:60
E R L L T V G H P Y F P V K D V Q E P H P:20
. . . . . . G:5584
AAAGTATTAGTTCCTAAGGTTTCAGGAAGTCAATTTAGAGTGTTTAGATTCAATTTGCCA C:60
K V L V P K V S G S Q F R V F R F N L P P:20
. . . . . . G:5644
GACCCAAACAGATTTGCTTTAATTGATAATGGCTTTTATGATTCTGATCATGAACGCCTA C:60
D P N R F A L I D N G F Y D S D H E R L P:20
. . . . . . G:5704
GTATGGAAACTGAGGGGAATAGAAATAGGAAGAGGAGGACCGCTTGGTATAGGTACTACA C:60
V W K L R G I E I G R G G P L G I G T T P:20
. . . . . . G:5764
GGTCATCCTTTATATAATAAGTTTGGAGACACAGAAAATCCTAATGGCTACAAAAAGCAA C:60
G H P L Y N K F G D T E N P N G Y K K Q P:20
. . . . . . G:5824
TCAGATGATAATAGACAGGATGTCTCTTTAGACCCAAAACAAACACAGATGTTTATTATA C:60
S D D N R Q D V S L D P K Q T Q M F I I P:20
. . . . . . G:5884
GGTTGCACTCCTGCAATAGGTGAACATTGGGATAAAGCTGAACCTTGTCCCAGCCCTGCT C:60
G C T P A I G E H W D K A E P C P S P A P:20
. . . . . . G:5944
CCGCAACAGGGAGATTGCCCACCAATAGAGCTTGTAAATTCATACATTCAAGATGGAGAT C:60
P Q Q G D C P P I E L V N S Y I Q D G D P:20
. . . . . . G:6004
ATGTGTGACATTGGATTTGGGGCTTTCAATTTTAAAGCTTTGCAGGCTGATAAATCTAGT C:60
M C D I G F G A F N F K A L Q A D K S S P:20
. . . . . . G:6064
GCTCCTTTGGATGTCATTGCCACAGTTTGTAAATGGCCAGATTTTTTAAAAATGGGGAAA C:60
A P L D V I A T V C K W P D F L K M G K P:20
. . . . . . G:6124
GATATCTATGGAGATAGCTTGTTTTTCTTTGGAAGAAGAGAACAACTATATGCCAGACAT C:60
D I Y G D S L F F F G R R E Q L Y A R H P:20
. . . . . . G:6184
TTCTTTGTCAGAGCAGGCACCATGGGAGATGCTCTACCAGAACCTTTTGAAGCTACCTCA C:60
F F V R A G T M G D A L P E P F E A T S P:20
. . . . . . G:6244
GATTATTTTATTGGTGCTCAAAACCAACAAGATCAGTACACTTTAGGACCTCATATTTAT C:60
D Y F I G A Q N Q Q D Q Y T L G P H I Y P:20
. . . . . . G:6304
GTAGGGACCCCTAGTGGCTCTTTAGTATCCAGTGAATCCCAGTTGTTTAATCGACCGTAT C:60
V G T P S G S L V S S E S Q L F N R P Y P:20
. . . . . . G:6364
TGGTTAAACAGAGCTCAGGGTACAAATAATGGAATTTGTTGGGATAATCAGTTGTTTGTT C:60
W L N R A Q G T N N G I C W D N Q L F V P:20
. . . . . . G:6424
ACTCTTGTAGATAACACTCATAATACAAACTTTACAATTTCTGTGAAGTCAGATGGTGCT C:60
T L V D N T H N T N F T I S V K S D G A P:20
. . . . . . G:6484
AATGACAATTATCAGTATAAAGCTAGTGATTTTAAACAGTACCTCAGACATATAGAGGAG C:60
N D N Y Q Y K A S D F K Q Y L R H I E E P:20
. . . . . . G:6544
TTTGAAATGGAATTTATATTTCAACTTTGTAAAGTTCCTCTAACTGCAGATGTTATGGCT C:60
F E M E F I F Q L C K V P L T A D V M A P:20
. . . . . . G:6604
CATTTAAATGTAATGAATCCTAATATTTTGGATAATTGGCAGTTAAATTTTGTTCCACCA C:60
H L N V M N P N I L D N W Q L N F V P P P:20
. . . . . . G:6664
CCTCCCTCTGGAATTGAGGATCAATATAGATTTTTGCAATCTAGAGCTACAAGATGCCCT C:60
P P S G I E D Q Y R F L Q S R A T R C P P:20
. . . . . . G:6724
ACACAGACCCCTGCAACTGAAAAAGAAGATCCATATAAAGATTTGTCTTTTTGGGTTGTT C:60
T Q T P A T E K E D P Y K D L S F W V V P:20
. . . . . . G:6784
GATTTAAGTGAAAGATTTTCCAGTGAATTGAGCCAATTTTCCTTAGGCAGGCGGTTTTTA C:60
D L S E R F S S E L S Q F S L G R R F L P:20
. . . . . . G:6844
TATCAAAGTGGTTTAATTAATGGTTCTCTAAAACGTAAAAGAATAATAAGTTCTTCTCAT C:60
Y Q S G L I N G S L K R K R I I S S S H P:20
. . . . . G:6895
GCACAAACTAATACCAAACGTTCTGCCAAACGAAAACGGTCTCTGAAATAA C:51
A Q T N T K R S A K R K R S L K P:16
