HPV4 L1

Accession: H003097
NC: NP_040895.1
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 4

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5404
ATGTCGAGTTGGTTATCTACAACGGGTAAAGTCTACTTACCTCCAGCTCAACCTGTGGCA     C:60
M S S W L S T T G K V Y L P P A Q P V A      P:20


. . . . . .     G:5464
AGAGTTTTGGAAACTGACGAATATATCACTGGAACATCTCTGTATTTCCACGCTGGTACA     C:60
R V L E T D E Y I T G T S L Y F H A G T      P:20


. . . . . .     G:5524
GAAAGGCTTTTAACTGTAGGCCATCCTTATTTTCCAGTGAAAGATGTACAGGAACCTCAC     C:60
E R L L T V G H P Y F P V K D V Q E P H      P:20


. . . . . .     G:5584
AAAGTATTAGTTCCTAAGGTTTCAGGAAGTCAATTTAGAGTGTTTAGATTCAATTTGCCA     C:60
K V L V P K V S G S Q F R V F R F N L P      P:20


. . . . . .     G:5644
GACCCAAACAGATTTGCTTTAATTGATAATGGCTTTTATGATTCTGATCATGAACGCCTA     C:60
D P N R F A L I D N G F Y D S D H E R L      P:20


. . . . . .     G:5704
GTATGGAAACTGAGGGGAATAGAAATAGGAAGAGGAGGACCGCTTGGTATAGGTACTACA     C:60
V W K L R G I E I G R G G P L G I G T T      P:20


. . . . . .     G:5764
GGTCATCCTTTATATAATAAGTTTGGAGACACAGAAAATCCTAATGGCTACAAAAAGCAA     C:60
G H P L Y N K F G D T E N P N G Y K K Q      P:20


. . . . . .     G:5824
TCAGATGATAATAGACAGGATGTCTCTTTAGACCCAAAACAAACACAGATGTTTATTATA     C:60
S D D N R Q D V S L D P K Q T Q M F I I      P:20


. . . . . .     G:5884
GGTTGCACTCCTGCAATAGGTGAACATTGGGATAAAGCTGAACCTTGTCCCAGCCCTGCT     C:60
G C T P A I G E H W D K A E P C P S P A      P:20


. . . . . .     G:5944
CCGCAACAGGGAGATTGCCCACCAATAGAGCTTGTAAATTCATACATTCAAGATGGAGAT     C:60
P Q Q G D C P P I E L V N S Y I Q D G D      P:20


. . . . . .     G:6004
ATGTGTGACATTGGATTTGGGGCTTTCAATTTTAAAGCTTTGCAGGCTGATAAATCTAGT     C:60
M C D I G F G A F N F K A L Q A D K S S      P:20


. . . . . .     G:6064
GCTCCTTTGGATGTCATTGCCACAGTTTGTAAATGGCCAGATTTTTTAAAAATGGGGAAA     C:60
A P L D V I A T V C K W P D F L K M G K      P:20


. . . . . .     G:6124
GATATCTATGGAGATAGCTTGTTTTTCTTTGGAAGAAGAGAACAACTATATGCCAGACAT     C:60
D I Y G D S L F F F G R R E Q L Y A R H      P:20


. . . . . .     G:6184
TTCTTTGTCAGAGCAGGCACCATGGGAGATGCTCTACCAGAACCTTTTGAAGCTACCTCA     C:60
F F V R A G T M G D A L P E P F E A T S      P:20


. . . . . .     G:6244
GATTATTTTATTGGTGCTCAAAACCAACAAGATCAGTACACTTTAGGACCTCATATTTAT     C:60
D Y F I G A Q N Q Q D Q Y T L G P H I Y      P:20


. . . . . .     G:6304
GTAGGGACCCCTAGTGGCTCTTTAGTATCCAGTGAATCCCAGTTGTTTAATCGACCGTAT     C:60
V G T P S G S L V S S E S Q L F N R P Y      P:20


. . . . . .     G:6364
TGGTTAAACAGAGCTCAGGGTACAAATAATGGAATTTGTTGGGATAATCAGTTGTTTGTT     C:60
W L N R A Q G T N N G I C W D N Q L F V      P:20


. . . . . .     G:6424
ACTCTTGTAGATAACACTCATAATACAAACTTTACAATTTCTGTGAAGTCAGATGGTGCT     C:60
T L V D N T H N T N F T I S V K S D G A      P:20


. . . . . .     G:6484
AATGACAATTATCAGTATAAAGCTAGTGATTTTAAACAGTACCTCAGACATATAGAGGAG     C:60
N D N Y Q Y K A S D F K Q Y L R H I E E      P:20


. . . . . .     G:6544
TTTGAAATGGAATTTATATTTCAACTTTGTAAAGTTCCTCTAACTGCAGATGTTATGGCT     C:60
F E M E F I F Q L C K V P L T A D V M A      P:20


. . . . . .     G:6604
CATTTAAATGTAATGAATCCTAATATTTTGGATAATTGGCAGTTAAATTTTGTTCCACCA     C:60
H L N V M N P N I L D N W Q L N F V P P      P:20


. . . . . .     G:6664
CCTCCCTCTGGAATTGAGGATCAATATAGATTTTTGCAATCTAGAGCTACAAGATGCCCT     C:60
P P S G I E D Q Y R F L Q S R A T R C P      P:20


. . . . . .     G:6724
ACACAGACCCCTGCAACTGAAAAAGAAGATCCATATAAAGATTTGTCTTTTTGGGTTGTT     C:60
T Q T P A T E K E D P Y K D L S F W V V      P:20


. . . . . .     G:6784
GATTTAAGTGAAAGATTTTCCAGTGAATTGAGCCAATTTTCCTTAGGCAGGCGGTTTTTA     C:60
D L S E R F S S E L S Q F S L G R R F L      P:20


. . . . . .     G:6844
TATCAAAGTGGTTTAATTAATGGTTCTCTAAAACGTAAAAGAATAATAAGTTCTTCTCAT     C:60
Y Q S G L I N G S L K R K R I I S S S H      P:20


. . . . .      G:6895
GCACAAACTAATACCAAACGTTCTGCCAAACGAAAACGGTCTCTGAAATAA      C:51
A Q T N T K R S A K R K R S L K      P:16