HPV88 E1

Accession: H002831
NC: YP_001672010.1
Protein: E1
Organism: Human papillomavirus type 88

Function

ATP-dependent DNA helicase required for initiation of viral DNA replication. It forms a complex with the viral E2 protein.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:841
ATGGCAGACCCCAATAAAGGTACTGATACTACTGATAATTTTGACTGTAATTCTGAATGG     C:60
M A D P N K G T D T T D N F D C N S E W      P:20


. . . . . .     G:901
TTACTTGTAGATGAAGCAGAATGTGTAGACGATTTAGATGTACTTGATGAATTGTTAGAA     C:60
L L V D E A E C V D D L D V L D E L L E      P:20


. . . . . .     G:961
GAAAGTACGCAATGTTCAACGGTTTCAAACTTGATTGATGATGACCCAGTTGATATTGAG     C:60
E S T Q C S T V S N L I D D D P V D I E      P:20


. . . . . .     G:1021
GATCAGGGAAATTCCCTGGCCTTATTCAACAGTCAGGTAACAGAGGATTGTAACACAGCT     C:60
D Q G N S L A L F N S Q V T E D C N T A      P:20


. . . . . .     G:1081
ATAAGCGCCCTAAAACGAAAGTTAATCAAAAGTCCGCAGCTGCAGACTGTTGCTGAGTTG     C:60
I S A L K R K L I K S P Q L Q T V A E L      P:20


. . . . . .     G:1141
AGTCCAAGGCTTCAAGCAGTTTCAATTTCACCCAAAAAACAAAGCAAAAGACGCTTATTC     C:60
S P R L Q A V S I S P K K Q S K R R L F      P:20


. . . . . .     G:1201
GATGACAGTGGCATAGGAGAAGATGAAGCTCAAAATACTTCTCAGGTAGCGTTGGACTCC     C:60
D D S G I G E D E A Q N T S Q V A L D S      P:20


. . . . . .     G:1261
TTAGAAAGCTCCTTAGAGACATCGGGAGCTGGGCTAACTATTAACCTTTTACATTGCAGC     C:60
L E S S L E T S G A G L T I N L L H C S      P:20


. . . . . .     G:1321
AACCGACAGGCAACCGTCCATCTAAAATTTAAAGAACTCTATGGTGTATCATTTAAAGAA     C:60
N R Q A T V H L K F K E L Y G V S F K E      P:20


. . . . . .     G:1381
CTAACTAGAAATTTTAAAAGTGATAAGTCTTGTTCCAATAGCTGGGTAATTGCTGTGTAT     C:60
L T R N F K S D K S C S N S W V I A V Y      P:20


. . . . . .     G:1441
AATGCTGTAGAAGAAGTTCTGGAGGCATCAAAGGTGCAGCTTCAGAAGCATGTAGAGTTC     C:60
N A V E E V L E A S K V Q L Q K H V E F      P:20


. . . . . .     G:1501
TTACAGTTAATAGTGTATGGATTTCATGGGTTGTATCTAATTGTATTTAAAAGCACTAAA     C:60
L Q L I V Y G F H G L Y L I V F K S T K      P:20


. . . . . .     G:1561
AATAGAGATACTGTATCTAAATTGTTTACGGAAATGTTAAATGTTAATGCTTTACAATTA     C:60
N R D T V S K L F T E M L N V N A L Q L      P:20


. . . . . .     G:1621
ATGTGTGATCCACCAAGGACAAGAAGTGTTCCGGTAGCGTTATTTTTTTATAGAAAAAGT     C:60
M C D P P R T R S V P V A L F F Y R K S      P:20


. . . . . .     G:1681
TTGGGAAATGCTTCTTTTATGTATGGAGAAGTTCCAGATTGGATTAAAAAACAAACCTTG     C:60
L G N A S F M Y G E V P D W I K K Q T L      P:20


. . . . . .     G:1741
GTAGAGCATCAGTCTGCGTCAGCAGCAGAGACATTTGATTTTAGCTCTATGGTTCAATGG     C:60
V E H Q S A S A A E T F D F S S M V Q W      P:20


. . . . . .     G:1801
GCATATGATAATGAATTCACAGAAGAAGCAGAAATTGCCTATCAATATGCTTTGGCAGCA     C:60
A Y D N E F T E E A E I A Y Q Y A L A A      P:20


. . . . . .     G:1861
GATGAAGATCCAAATGCCGAGGCATTTTTAAAACATAATAATCAGTATAAATTTGTAAAA     C:60
D E D P N A E A F L K H N N Q Y K F V K      P:20


. . . . . .     G:1921
GATTGTGCCGCAATGGTAAAAATGTATAGAAGGTATGAATTGAGACAAATGTCAATGGCT     C:60
D C A A M V K M Y R R Y E L R Q M S M A      P:20


. . . . . .     G:1981
GAATGGATAGATAAATGTTGTTCAAAATGTACCGAAAATGGTAACTGGAAAATAATTGCT     C:60
E W I D K C C S K C T E N G N W K I I A      P:20


. . . . . .     G:2041
ACATTTCTGAAACATCAGAATGTACAATTTTTATCATTTCTCATTGCATTGAAACCTTTC     C:60
T F L K H Q N V Q F L S F L I A L K P F      P:20


. . . . . .     G:2101
TTACAGGGTGTTCCAAAGAAGAATTGTCTGGTGTTTGTTGGGCCCCCTGACACTGGGAAA     C:60
L Q G V P K K N C L V F V G P P D T G K      P:20


. . . . . .     G:2161
TCATATTTCTGCTTCTCATTAATACGTTTTTTTGGGGGAAAAGTTGTGTCCTTTATGAAT     C:60
S Y F C F S L I R F F G G K V V S F M N      P:20


. . . . . .     G:2221
AGAAATAGTCATTTCTGGTTACAACCATTGCAAGATACTAAATTAGGCTTCCTAGATGAT     C:60
R N S H F W L Q P L Q D T K L G F L D D      P:20


. . . . . .     G:2281
GCAACACATCCATGTTGGGTGTATATGGATATTAACCTTCGGAATGGACTAGATGGTAAT     C:60
A T H P C W V Y M D I N L R N G L D G N      P:20


. . . . . .     G:2341
CTTGTATCTCTTGATGCAAAGCATAGAGCTCCAATGCAAATGAAATTACCTCCTTTACTT     C:60
L V S L D A K H R A P M Q M K L P P L L      P:20


. . . . . .     G:2401
GTTACCACTAACGTGGATGTAATGGAGGATCAATCCTTAAGATATCTGCATAGTAGACTA     C:60
V T T N V D V M E D Q S L R Y L H S R L      P:20


. . . . . .     G:2461
GTATGTTTTAAATTCCCTAACAAATTACCACTGAATGACGATGGCTCCCTTGTATATGAA     C:60
V C F K F P N K L P L N D D G S L V Y E      P:20


. . . . . .     G:2521
ATAACGAATGATACATGGGCCTGTTTTTTTAGAAAATTTGCTACCCAGTTAAACCTGGTC     C:60
I T N D T W A C F F R K F A T Q L N L V      P:20


. . . . . .     G:2581
TTAGAAGATGGCGAGAATGGAAACACAGGAAACTCTGACAGAACGTTTCGTTGCACTGCA     C:60
L E D G E N G N T G N S D R T F R C T A      P:20


. .      G:2605
AGATGCCATATTGAATCTAATTGA      C:24
R C H I E S N      P:7