HPV6 L2

Accession: H002806

Protein: L2

Organism: Human papillomavirus type 6

Function

Minor capsid protein. It is required for DNA packaging. It mediates several facets of viral entry including endosomal escape after uncoating.

Mutation

4424-4500

4501-4600

4601-4700

4701-4800

4801-4900

4901-5000

5001-5100

5101-5200

5201-5300

5301-5400

5401-5500

5501-5600

5601-5700

5701-5800

5801-5803

Legend:same sensemissenseinsertiondeletion

Mutation type	Position	DESC	Disease	Reference
missense	4603	A → G (T → A)	Disease: Condyloma acuminate Region : Henan, Liaoning	Ref
same sense	4732	T → C	Disease: Condyloma acuminate Region : Henan, Liaoning	Ref
missense	5218	G → A (D → N)	Disease: Condyloma acuminate Region : Henan, Liaoning	Ref
same sense	5406	G → A	Disease: Condyloma acuminate Region : Henan, Liaoning	Ref
missense	5609	T → C (L → P)	Disease: Condyloma acuminate Region : Henan, Liaoning	Ref

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Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4483
atggcacatagtagggcccgacgacgcaagcgtgcgtcagctacacagctatatcaaaca　　　　　C:60
 M  A  H  S  R  A  R  R  R  K  R  A  S  A  T  Q  L  Y  Q  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4543
tgtaaactcactggaacatgccccccagatgtaattcctaaggtggaacacaacaccatt　　　　　C:60
 C  K  L  T  G  T  C  P  P  D  V  I  P  K  V  E  H  N  T  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4603
gcagatcaaatattaaaatgggggagtttgggggtgttttttggagggttgggtataggc　　　　　C:60
 A  D  Q  I  L  K  W  G  S  L  G  V  F  F  G  G  L  G  I  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4663
accggttccggcactgggggtcgtactggctatgttcccttaggaacttctgcaaaacct　　　　　C:60
 T  G  S  G  T  G  G  R  T  G  Y  V  P  L  G  T  S  A  K  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4723
tctattactagtgggcctatggctcgtcctcctgtggtggtggagcctgtggccccttcg　　　　　C:60
 S  I  T  S  G  P  M  A  R  P  P  V  V  V  E  P  V  A  P  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4783
gatccatccattgtgtctttaattgaagaatcggcaatcattaacgcaggggcgcctgaa　　　　　C:60
 D  P  S  I  V  S  L  I  E  E  S  A  I  I  N  A  G  A  P  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4843
attgtgccccctgcacacggtgggtttacaattacatcctctgaaacaactacccctgca　　　　　C:60
 I  V  P  P  A  H  G  G  F  T  I  T  S  S  E  T  T  T  P  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4903
atattggatgtatcagttactagtcatactactactagtatatttagaaatcctgtcttt　　　　　C:60
 I  L  D  V  S  V  T  S  H  T  T  T  S  I  F  R  N  P  V  F 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:4963
acagaaccttctgtaacacaaccccaaccacccgtggaggctaatggacatatattaatt　　　　　C:60
 T  E  P  S  V  T  Q  P  Q  P  P  V  E  A  N  G  H  I  L  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5023
tctgcacccactataacgtcacaccctatagaggaaattcctttagatacttttgtgata　　　　　C:60
 S  A  P  T  I  T  S  H  P  I  E  E  I  P  L  D  T  F  V  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5083
tcctctagtgatagcggtcctacatccagtacccctgttcctggtactgcacctcggcct　　　　　C:60
 S  S  S  D  S  G  P  T  S  S  T  P  V  P  G  T  A  P  R  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5143
cgtgtgggcctatatagtcgtgcattgcaccaggtgcaggttacagaccctgcatttctt　　　　　C:60
 R  V  G  L  Y  S  R  A  L  H  Q  V  Q  V  T  D  P  A  F  L 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5203
tccactcctcaacgcttaattacatatgataaccctgtatatgaaggggaggatgttagt　　　　　C:60
 S  T  P  Q  R  L  I  T  Y  D  N  P  V  Y  E  G  E  D  V  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5263
gtacaatttagtcatgattctatacacaatgcacctgatgaggcttttatggacataatt　　　　　C:60
 V  Q  F  S  H  D  S  I  H  N  A  P  D  E  A  F  M  D  I  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5323
cgtttgcacagacctgctattgcgtcccgacgtggccttgtgcggtacagtcgcattgga　　　　　C:60
 R  L  H  R  P  A  I  A  S  R  R  G  L  V  R  Y  S  R  I  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5383
caacgggggtctatgcacactcgcagcggaaagcacataggggcccgcattcattatttt　　　　　C:60
 Q  R  G  S  M  H  T  R  S  G  K  H  I  G  A  R  I  H  Y  F 　　　　　P:20


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tatgatatttcacctattgcacaagctgcagaagaaatagaaatgcaccctcttgtggct　　　　　C:60
 Y  D  I  S  P  I  A  Q  A  A  E  E  I  E  M  H  P  L  V  A 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5503
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 A  Q  E  D  T  F  D  I  Y  A  E  S  F  E  P  D  I  N  P  T 　　　　　P:20


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         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5623
caaccgtggggtaacaccacagttccattgtcaattcctaatgacctgtttttacagtct　　　　　C:60
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ggccctgatataacttttcctactgcacctatgggaacaccctttagtcctgtaactcct　　　　　C:60
 G  P  D  I  T  F  P  T  A  P  M  G  T  P  F  S  P  V  T  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:5743
gctttacctacaggccctgttttcattacaggttctggattttatttgcatcctgcatgg　　　　　C:60
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                                                            　　　　　G:5803
tattttgcacgtaaacgccgtaaacgtattcccttatttttttcagatgtggcggcctag　　　　　C:0
 Y  F  A  R  K  R  R  K  R  I  P  L  F  F  S  D  V  A  A    　　　　　P:19

DETAIL