HPV54 L1
Accession: H000129
NC: NP_043294.1
Uniprot: P50819
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 54
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5673
ATGTGGCGGCCTAGCGAAAACAAAGTATACCTGCCTCCTACCCCAGTTTCTAAGGTTGTC C:60
M W R P S E N K V Y L P P T P V S K V V P:20
. . . . . . G:5733
AGCACGGATGAATATGTGACTCGCACAAGCATATACTATCATGCAAGCAGCTCTAGATTA C:60
S T D E Y V T R T S I Y Y H A S S S R L P:20
. . . . . . G:5793
TTGGCTGTTGGACATCCATATTTTAAAGTACAAAAAACCAATAATAAGCAAAGTATTCCT C:60
L A V G H P Y F K V Q K T N N K Q S I P P:20
. . . . . . G:5853
AAAGTATCAGGATATCAATATAGGGTGTTTAGGGTGCAACTACCTGATCCTAATAAGTTT C:60
K V S G Y Q Y R V F R V Q L P D P N K F P:20
. . . . . . G:5913
GGACTGCCTGATCCTAGTTTATATAATCCTGAGACACAACGCTTAGTATGGGCATGCACA C:60
G L P D P S L Y N P E T Q R L V W A C T P:20
. . . . . . G:5973
GGTGTGGAGGTTGGTAGGGGCCAGCCATTGGGTCTTGGCCTAAGTGGTCATCCATTATTA C:60
G V E V G R G Q P L G L G L S G H P L L P:20
. . . . . . G:6033
AATAAATTGGATGATACTGAAAATGCACCTAAATATGTTGGTGCAGGAGCTGACAATAGG C:60
N K L D D T E N A P K Y V G A G A D N R P:20
. . . . . . G:6093
GAAAATGTTAGCATGGACTATAAACAAACACAGTTATGTATTTTGGGCTGCACACCACCT C:60
E N V S M D Y K Q T Q L C I L G C T P P P:20
. . . . . . G:6153
ATAGGTGAACACTGGGCTAAAGGCAACCTATGTACACCTAATACATTGGCTGCTGGTGAC C:60
I G E H W A K G N L C T P N T L A A G D P:20
. . . . . . G:6213
TGTCCTCCTTTGGAATTAGTAAATTCATATATACAGGATGGTGATATGGTAGATATAGGA C:60
C P P L E L V N S Y I Q D G D M V D I G P:20
. . . . . . G:6273
TTTGGGGCTATGGATTTTAAAACCCTACAAACCTCAAAAAGTGAGGTACCCCTTGATGTA C:60
F G A M D F K T L Q T S K S E V P L D V P:20
. . . . . . G:6333
GCTACCTCAATTTGTAAATATCCTGATTACCTTAAAATGGCTGCAGAGGCATATGGGGAC C:60
A T S I C K Y P D Y L K M A A E A Y G D P:20
. . . . . . G:6393
AGTTTATTTTTTTACTTAAGGCGGGAACAAATGTTTGTTAGGCATATGTTAAATAGGGCA C:60
S L F F Y L R R E Q M F V R H M L N R A P:20
. . . . . . G:6453
GGTACCATGGGTGAGCCTGTACCTAATGACTTATACATTAAGAAATCCTCAGGTAACCTT C:60
G T M G E P V P N D L Y I K K S S G N L P:20
. . . . . . G:6513
GACAGTTCTATTTATGCTGCAACTCCTAGTGGCTCTATGGTAACATCTGAATACCAAATA C:60
D S S I Y A A T P S G S M V T S E Y Q I P:20
. . . . . . G:6573
TTTAATAAGCCATACTGGTTACAACGGGCCCAGGGTCAAAACAATGGTATTTGTTGGGGC C:60
F N K P Y W L Q R A Q G Q N N G I C W G P:20
. . . . . . G:6633
AATCAGGTGTTTTTAACAGTTGTAGATACCACCCGTAGTACTAACCTAACATTGTGTGCT C:60
N Q V F L T V V D T T R S T N L T L C A P:20
. . . . . . G:6693
ACAGCATCCACGCAGGATAGCTTTAATAATTCTGACTTTAGGGAGTATATTAGACATGTG C:60
T A S T Q D S F N N S D F R E Y I R H V P:20
. . . . . . G:6753
GAGGAATATGATTTACAGTTTATATTTCAGTTATGTACCATAACCCTTACAGCAGATGTT C:60
E E Y D L Q F I F Q L C T I T L T A D V P:20
. . . . . . G:6813
ATGGCCTATATTCATGGAATGAATCCCACTATTCTAGAGGACTGGAACTTTGGTATAACC C:60
M A Y I H G M N P T I L E D W N F G I T P:20
. . . . . . G:6873
CCCCCAGCTACAAGTAGTTTGGAGGACACATATAGGTTTGTACAGTCACAGGCCATTGCA C:60
P P A T S S L E D T Y R F V Q S Q A I A P:20
. . . . . . G:6933
TGTCAAAAGAATAATGCCCCTGCAAAGGAAAAGGAGGATCCTTACAGTAAATTTAATTTT C:60
C Q K N N A P A K E K E D P Y S K F N F P:20
. . . . . . G:6993
TGGACTGTTGACCTTAAGGAACGATTTTCATCTGACCTTGACCAGTTTCCCTTGGGTCGC C:60
W T V D L K E R F S S D L D Q F P L G R P:20
. . . . . . G:7053
AAGTTTTTACTACAGGCTGGCCTACGTGCACGTCCGCGCCTTCGGCCTGTAAAGCGTGCA C:60
K F L L Q A G L R A R P R L R P V K R A P:20
. . . . . G:7107
GCCCCTTCCTCCTCTAAGGGTACAGCGCGCAAGCGTGCTAAAACTAAAAGGTAA C:54
A P S S S K G T A R K R A K T K R P:17
