HPV54 L1

Accession: H000129
NC: NP_043294.1
Uniprot: P50819
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 54

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5673
ATGTGGCGGCCTAGCGAAAACAAAGTATACCTGCCTCCTACCCCAGTTTCTAAGGTTGTC     C:60
M W R P S E N K V Y L P P T P V S K V V      P:20


. . . . . .     G:5733
AGCACGGATGAATATGTGACTCGCACAAGCATATACTATCATGCAAGCAGCTCTAGATTA     C:60
S T D E Y V T R T S I Y Y H A S S S R L      P:20


. . . . . .     G:5793
TTGGCTGTTGGACATCCATATTTTAAAGTACAAAAAACCAATAATAAGCAAAGTATTCCT     C:60
L A V G H P Y F K V Q K T N N K Q S I P      P:20


. . . . . .     G:5853
AAAGTATCAGGATATCAATATAGGGTGTTTAGGGTGCAACTACCTGATCCTAATAAGTTT     C:60
K V S G Y Q Y R V F R V Q L P D P N K F      P:20


. . . . . .     G:5913
GGACTGCCTGATCCTAGTTTATATAATCCTGAGACACAACGCTTAGTATGGGCATGCACA     C:60
G L P D P S L Y N P E T Q R L V W A C T      P:20


. . . . . .     G:5973
GGTGTGGAGGTTGGTAGGGGCCAGCCATTGGGTCTTGGCCTAAGTGGTCATCCATTATTA     C:60
G V E V G R G Q P L G L G L S G H P L L      P:20


. . . . . .     G:6033
AATAAATTGGATGATACTGAAAATGCACCTAAATATGTTGGTGCAGGAGCTGACAATAGG     C:60
N K L D D T E N A P K Y V G A G A D N R      P:20


. . . . . .     G:6093
GAAAATGTTAGCATGGACTATAAACAAACACAGTTATGTATTTTGGGCTGCACACCACCT     C:60
E N V S M D Y K Q T Q L C I L G C T P P      P:20


. . . . . .     G:6153
ATAGGTGAACACTGGGCTAAAGGCAACCTATGTACACCTAATACATTGGCTGCTGGTGAC     C:60
I G E H W A K G N L C T P N T L A A G D      P:20


. . . . . .     G:6213
TGTCCTCCTTTGGAATTAGTAAATTCATATATACAGGATGGTGATATGGTAGATATAGGA     C:60
C P P L E L V N S Y I Q D G D M V D I G      P:20


. . . . . .     G:6273
TTTGGGGCTATGGATTTTAAAACCCTACAAACCTCAAAAAGTGAGGTACCCCTTGATGTA     C:60
F G A M D F K T L Q T S K S E V P L D V      P:20


. . . . . .     G:6333
GCTACCTCAATTTGTAAATATCCTGATTACCTTAAAATGGCTGCAGAGGCATATGGGGAC     C:60
A T S I C K Y P D Y L K M A A E A Y G D      P:20


. . . . . .     G:6393
AGTTTATTTTTTTACTTAAGGCGGGAACAAATGTTTGTTAGGCATATGTTAAATAGGGCA     C:60
S L F F Y L R R E Q M F V R H M L N R A      P:20


. . . . . .     G:6453
GGTACCATGGGTGAGCCTGTACCTAATGACTTATACATTAAGAAATCCTCAGGTAACCTT     C:60
G T M G E P V P N D L Y I K K S S G N L      P:20


. . . . . .     G:6513
GACAGTTCTATTTATGCTGCAACTCCTAGTGGCTCTATGGTAACATCTGAATACCAAATA     C:60
D S S I Y A A T P S G S M V T S E Y Q I      P:20


. . . . . .     G:6573
TTTAATAAGCCATACTGGTTACAACGGGCCCAGGGTCAAAACAATGGTATTTGTTGGGGC     C:60
F N K P Y W L Q R A Q G Q N N G I C W G      P:20


. . . . . .     G:6633
AATCAGGTGTTTTTAACAGTTGTAGATACCACCCGTAGTACTAACCTAACATTGTGTGCT     C:60
N Q V F L T V V D T T R S T N L T L C A      P:20


. . . . . .     G:6693
ACAGCATCCACGCAGGATAGCTTTAATAATTCTGACTTTAGGGAGTATATTAGACATGTG     C:60
T A S T Q D S F N N S D F R E Y I R H V      P:20


. . . . . .     G:6753
GAGGAATATGATTTACAGTTTATATTTCAGTTATGTACCATAACCCTTACAGCAGATGTT     C:60
E E Y D L Q F I F Q L C T I T L T A D V      P:20


. . . . . .     G:6813
ATGGCCTATATTCATGGAATGAATCCCACTATTCTAGAGGACTGGAACTTTGGTATAACC     C:60
M A Y I H G M N P T I L E D W N F G I T      P:20


. . . . . .     G:6873
CCCCCAGCTACAAGTAGTTTGGAGGACACATATAGGTTTGTACAGTCACAGGCCATTGCA     C:60
P P A T S S L E D T Y R F V Q S Q A I A      P:20


. . . . . .     G:6933
TGTCAAAAGAATAATGCCCCTGCAAAGGAAAAGGAGGATCCTTACAGTAAATTTAATTTT     C:60
C Q K N N A P A K E K E D P Y S K F N F      P:20


. . . . . .     G:6993
TGGACTGTTGACCTTAAGGAACGATTTTCATCTGACCTTGACCAGTTTCCCTTGGGTCGC     C:60
W T V D L K E R F S S D L D Q F P L G R      P:20


. . . . . .     G:7053
AAGTTTTTACTACAGGCTGGCCTACGTGCACGTCCGCGCCTTCGGCCTGTAAAGCGTGCA     C:60
K F L L Q A G L R A R P R L R P V K R A      P:20


. . . . .      G:7107
GCCCCTTCCTCCTCTAAGGGTACAGCGCGCAAGCGTGCTAAAACTAAAAGGTAA      C:54
A P S S S K G T A R K R A K T K R      P:17