HPV53 L1

Accession: H000128
NC: NP_041848.1
Uniprot: Q05113
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 53

Function

Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.

Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .     G:5714
ATGGCGGTGTGGCGGCCTAGTGACAGCAAGGTTTATCTGCCTCCTACCCCTGTATCAAAG     C:60
M A V W R P S D S K V Y L P P T P V S K      P:20


. . . . . .     G:5774
GTCATTACAACGGATGCCTATGTAAAACGCACCACTATATTTTATCATGCTGGAAGCTCT     C:60
V I T T D A Y V K R T T I F Y H A G S S      P:20


. . . . . .     G:5834
CGCTTGCTTACCGTGGGACATCCTTATTACCCCATTTCTAAATCTGGTAAAGCAGACATC     C:60
R L L T V G H P Y Y P I S K S G K A D I      P:20


. . . . . .     G:5894
CCTAAGGTGTCTGCATTTCAGTATAGGGTGTTTAGAGTACGCCTCCCAGATCCTAATAAG     C:60
P K V S A F Q Y R V F R V R L P D P N K      P:20


. . . . . .     G:5954
TTTGGCCTTCCTGATACAAATATATTTAATCCTGACCAGGAGCGGCTTGTATGGGCCTGT     C:60
F G L P D T N I F N P D Q E R L V W A C      P:20


. . . . . .     G:6014
GTAGGGCTAGAGATTGGCCGTGGACAGCCTTTAGGTGTTGGTGTAAGTGGCCATCCACTG     C:60
V G L E I G R G Q P L G V G V S G H P L      P:20


. . . . . .     G:6074
TTCAATAGGTTGGATGACACTGAAAGCTCTAGTATAGCTATTCAGGATACTGCCCCGGAC     C:60
F N R L D D T E S S S I A I Q D T A P D      P:20


. . . . . .     G:6134
AGTAGGGATAATGTTTCAGTGGATCCTAAACAAACACAGTTATGCATTATTGGCTGTGCA     C:60
S R D N V S V D P K Q T Q L C I I G C A      P:20


. . . . . .     G:6194
CCCGCTATAGGTGAACACTGGACAAAGGGTACGGCCTGTCGTTCCACACCTACTACAGCG     C:60
P A I G E H W T K G T A C R S T P T T A      P:20


. . . . . .     G:6254
GGCGACTGCCCCCCATTGGAACTTATCAATTCACCTATTGAGGATGGAGACATGGTGGAC     C:60
G D C P P L E L I N S P I E D G D M V D      P:20


. . . . . .     G:6314
ACAGGTTTTGGTGCATTAAACTTTAAAGCTTTGCAGGAATCTAAATCTGATGTGCCATTG     C:60
T G F G A L N F K A L Q E S K S D V P L      P:20


. . . . . .     G:6374
GATATTGTACAATCCACATGTAAATATCCCGATTATTTGAAAATGAGTGCAGATGCCTAT     C:60
D I V Q S T C K Y P D Y L K M S A D A Y      P:20


. . . . . .     G:6434
GGGGATTCTATGTGGTTTTATTTACGTAGGGAACAGTTGTTTACCAGACATTTTTTTAAT     C:60
G D S M W F Y L R R E Q L F T R H F F N      P:20


. . . . . .     G:6494
AGGGCAGGCGTTATTGGTGAGGAAATACCTAATGACTTATATATTAAGGGTAGTAATGGC     C:60
R A G V I G E E I P N D L Y I K G S N G      P:20


. . . . . .     G:6554
AGGGACCCGCCCCCTAGCTCTGTATATGTTGCTACACCTAGTGGGTCTATGATAACTTCA     C:60
R D P P P S S V Y V A T P S G S M I T S      P:20


. . . . . .     G:6614
GAGGCTCAATTGTTTAATAAGCCATATTGGCTGCAACGTGCCCAGGGACATAATAATGGC     C:60
E A Q L F N K P Y W L Q R A Q G H N N G      P:20


. . . . . .     G:6674
ATCTGTTGGAACAATCAGTTATTTGTAACTGTTGTGGATACCACCAGGAATACAAACATG     C:60
I C W N N Q L F V T V V D T T R N T N M      P:20


. . . . . .     G:6734
ACTCTTTCCGCAACCACACAGTCTATGTCTACATATAATTCAAAGCAAATTAAACAGTAT     C:60
T L S A T T Q S M S T Y N S K Q I K Q Y      P:20


. . . . . .     G:6794
GTTAGACATGCAGAGGAATATGAATTACAATTTGTGTTTCAACTATGTAAAATATCCCTG     C:60
V R H A E E Y E L Q F V F Q L C K I S L      P:20


. . . . . .     G:6854
TCTGCTGAGGTTATGGCCTATTTACATACTATGAATTCTACCTTACTGGAAGACTGGAAT     C:60
S A E V M A Y L H T M N S T L L E D W N      P:20


. . . . . .     G:6914
ATAGGTTTGTCGCCTCCTGTTGCCACTAGCTTAGAGGACAAATACAGATATGTGAAAAGT     C:60
I G L S P P V A T S L E D K Y R Y V K S      P:20


. . . . . .     G:6974
GCAGCTATAACCTGTCAAAAGGATCAGCCCCCTCCTGAAAAGCAGGACCCACTATCTAAA     C:60
A A I T C Q K D Q P P P E K Q D P L S K      P:20


. . . . . .     G:7034
TATAAATTTTGGGAGGTCAATTTGCAAAACAGTTTTTCTGCTGATTTGGATCAGTTTCCT     C:60
Y K F W E V N L Q N S F S A D L D Q F P      P:20


. . . . . .     G:7094
CTTGGCAGGAAGTTTTTAATGCAGGTTGGGGTCCGTACTAAACCGCCTGTATCCTCTAAA     C:60
L G R K F L M Q V G V R T K P P V S S K      P:20


     G:7154
AAACGCTCTGCTTCTACTACATCTACCTCAGCCCCCTCCTCCAAGCGCAAACGCAAATAG     C:0
K R S A S T T S T S A P S S K R K R K      P:19