HPV53 L1
Accession: H000128
NC: NP_041848.1
Uniprot: Q05113
Protein: L1
Organism: Human papillomavirus type 53
Function
Major capsid protein. It can form virus-like particles. It forms the pentameric assembly unit of the viral shell.
Sequence&Mutation
. . . . . . G:5714
ATGGCGGTGTGGCGGCCTAGTGACAGCAAGGTTTATCTGCCTCCTACCCCTGTATCAAAG C:60
M A V W R P S D S K V Y L P P T P V S K P:20
. . . . . . G:5774
GTCATTACAACGGATGCCTATGTAAAACGCACCACTATATTTTATCATGCTGGAAGCTCT C:60
V I T T D A Y V K R T T I F Y H A G S S P:20
. . . . . . G:5834
CGCTTGCTTACCGTGGGACATCCTTATTACCCCATTTCTAAATCTGGTAAAGCAGACATC C:60
R L L T V G H P Y Y P I S K S G K A D I P:20
. . . . . . G:5894
CCTAAGGTGTCTGCATTTCAGTATAGGGTGTTTAGAGTACGCCTCCCAGATCCTAATAAG C:60
P K V S A F Q Y R V F R V R L P D P N K P:20
. . . . . . G:5954
TTTGGCCTTCCTGATACAAATATATTTAATCCTGACCAGGAGCGGCTTGTATGGGCCTGT C:60
F G L P D T N I F N P D Q E R L V W A C P:20
. . . . . . G:6014
GTAGGGCTAGAGATTGGCCGTGGACAGCCTTTAGGTGTTGGTGTAAGTGGCCATCCACTG C:60
V G L E I G R G Q P L G V G V S G H P L P:20
. . . . . . G:6074
TTCAATAGGTTGGATGACACTGAAAGCTCTAGTATAGCTATTCAGGATACTGCCCCGGAC C:60
F N R L D D T E S S S I A I Q D T A P D P:20
. . . . . . G:6134
AGTAGGGATAATGTTTCAGTGGATCCTAAACAAACACAGTTATGCATTATTGGCTGTGCA C:60
S R D N V S V D P K Q T Q L C I I G C A P:20
. . . . . . G:6194
CCCGCTATAGGTGAACACTGGACAAAGGGTACGGCCTGTCGTTCCACACCTACTACAGCG C:60
P A I G E H W T K G T A C R S T P T T A P:20
. . . . . . G:6254
GGCGACTGCCCCCCATTGGAACTTATCAATTCACCTATTGAGGATGGAGACATGGTGGAC C:60
G D C P P L E L I N S P I E D G D M V D P:20
. . . . . . G:6314
ACAGGTTTTGGTGCATTAAACTTTAAAGCTTTGCAGGAATCTAAATCTGATGTGCCATTG C:60
T G F G A L N F K A L Q E S K S D V P L P:20
. . . . . . G:6374
GATATTGTACAATCCACATGTAAATATCCCGATTATTTGAAAATGAGTGCAGATGCCTAT C:60
D I V Q S T C K Y P D Y L K M S A D A Y P:20
. . . . . . G:6434
GGGGATTCTATGTGGTTTTATTTACGTAGGGAACAGTTGTTTACCAGACATTTTTTTAAT C:60
G D S M W F Y L R R E Q L F T R H F F N P:20
. . . . . . G:6494
AGGGCAGGCGTTATTGGTGAGGAAATACCTAATGACTTATATATTAAGGGTAGTAATGGC C:60
R A G V I G E E I P N D L Y I K G S N G P:20
. . . . . . G:6554
AGGGACCCGCCCCCTAGCTCTGTATATGTTGCTACACCTAGTGGGTCTATGATAACTTCA C:60
R D P P P S S V Y V A T P S G S M I T S P:20
. . . . . . G:6614
GAGGCTCAATTGTTTAATAAGCCATATTGGCTGCAACGTGCCCAGGGACATAATAATGGC C:60
E A Q L F N K P Y W L Q R A Q G H N N G P:20
. . . . . . G:6674
ATCTGTTGGAACAATCAGTTATTTGTAACTGTTGTGGATACCACCAGGAATACAAACATG C:60
I C W N N Q L F V T V V D T T R N T N M P:20
. . . . . . G:6734
ACTCTTTCCGCAACCACACAGTCTATGTCTACATATAATTCAAAGCAAATTAAACAGTAT C:60
T L S A T T Q S M S T Y N S K Q I K Q Y P:20
. . . . . . G:6794
GTTAGACATGCAGAGGAATATGAATTACAATTTGTGTTTCAACTATGTAAAATATCCCTG C:60
V R H A E E Y E L Q F V F Q L C K I S L P:20
. . . . . . G:6854
TCTGCTGAGGTTATGGCCTATTTACATACTATGAATTCTACCTTACTGGAAGACTGGAAT C:60
S A E V M A Y L H T M N S T L L E D W N P:20
. . . . . . G:6914
ATAGGTTTGTCGCCTCCTGTTGCCACTAGCTTAGAGGACAAATACAGATATGTGAAAAGT C:60
I G L S P P V A T S L E D K Y R Y V K S P:20
. . . . . . G:6974
GCAGCTATAACCTGTCAAAAGGATCAGCCCCCTCCTGAAAAGCAGGACCCACTATCTAAA C:60
A A I T C Q K D Q P P P E K Q D P L S K P:20
. . . . . . G:7034
TATAAATTTTGGGAGGTCAATTTGCAAAACAGTTTTTCTGCTGATTTGGATCAGTTTCCT C:60
Y K F W E V N L Q N S F S A D L D Q F P P:20
. . . . . . G:7094
CTTGGCAGGAAGTTTTTAATGCAGGTTGGGGTCCGTACTAAACCGCCTGTATCCTCTAAA C:60
L G R K F L M Q V G V R T K P P V S S K P:20
G:7154
AAACGCTCTGCTTCTACTACATCTACCTCAGCCCCCTCCTCCAAGCGCAAACGCAAATAG C:0
K R S A S T T S T S A P S S K R K R K P:19
