HPV53 E2

Accession: H000039

NC: NP_041846.1

Uniprot: P36797

Protein: E2

Organism: Human papillomavirus type 53

Function

It is responsible for recognition and binding of origin of replication. It exists in two forms such as full length (transcriptional transactivator) and truncated (transcriptional repressor). The ratio of these found in the heterotrimeric complex, formed b
Sequence&Mutation

         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2800
ATGGAGACGCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAA　　　　　C:60
 M  E  T  L  C  Q  R  L  D  A  C  Q  E  K  I  L  D  C  F  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2860
AGAGATAGCAAAAATATTACAGACCATATAGACTACTGGAAAGCTGTGCGACAAGAAAAT　　　　　C:60
 R  D  S  K  N  I  T  D  H  I  D  Y  W  K  A  V  R  Q  E  N 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2920
GTAATATATTATAAGGCAAGAGAAAATAATATGACTAAACTAGGCCACCAGGTGGTGCCC　　　　　C:60
 V  I  Y  Y  K  A  R  E  N  N  M  T  K  L  G  H  Q  V  V  P 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:2980
TGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGCGTTGCTATAGAACTACAAATAGCATTGGAA　　　　　C:60
 C  L  Q  V  C  K  A  K  A  C  V  A  I  E  L  Q  I  A  L  E 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3040
TCACTTTGTAAAACAGAATATAATATGGAAGAGTGGACATTAAGGGATGTATGTGAAAGT　　　　　C:60
 S  L  C  K  T  E  Y  N  M  E  E  W  T  L  R  D  V  C  E  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3100
ATGTGGTATACAGAACCCAAACAGTGTTTTAAAAAACAAGGACAACATATAGAAGTGTGG　　　　　C:60
 M  W  Y  T  E  P  K  Q  C  F  K  K  Q  G  Q  H  I  E  V  W 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3160
TTTGATGGCAGCAAGGACAATCGGGCTGAATATGTTGTGTGGAAATGGGTATATTATTGT　　　　　C:60
 F  D  G  S  K  D  N  R  A  E  Y  V  V  W  K  W  V  Y  Y  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3220
GGGGAGGATGGGTGGTGTAAAGTGTCTTCTGCAGTAAGCTATGAGGGCATATATTATATA　　　　　C:60
 G  E  D  G  W  C  K  V  S  S  A  V  S  Y  E  G  I  Y  Y  I 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3280
CATGACGGCCATAAAACGTATTATACAAACTTTAAAGACGAGGCCACCAAATATGGGTGT　　　　　C:60
 H  D  G  H  K  T  Y  Y  T  N  F  K  D  E  A  T  K  Y  G  C 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3340
AAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAAACAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCC　　　　　C:60
 K  G  T  W  E  V  H  M  G  K  Q  S  I  Y  C  P  D  S  V  S 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3400
AGTACCTTTAGATCCAACGTATCCTCTGTTGAAACTGTTAACGAATACTACTCCCATAAG　　　　　C:60
 S  T  F  R  S  N  V  S  S  V  E  T  V  N  E  Y  Y  S  H  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3460
ACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCACCTACGAAGCCTCATCATCCCTGCGGCCGGGA　　　　　C:60
 T  P  T  T  S  T  P  V  G  T  Y  E  A  S  S  S  L  R  P  G 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3520
AAACGTCCCAGAACCACAGAGCCCGACAGTACTGACTCCACCACACAGTCCACTACCACA　　　　　C:60
 K  R  P  R  T  T  E  P  D  S  T  D  S  T  T  Q  S  T  T  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3580
GCCAGAGAGTCCTACGCAGAGTGTGTCGCAAGGAACACAGACAACACAAACAACAACACC　　　　　C:60
 A  R  E  S  Y  A  E  C  V  A  R  N  T  D  N  T  N  N  N  T 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3640
AGAAAACACCTCCCTGGTGGAGCTTCGTGTAACAACACCGAAATCGACAGTGGTTATAAG　　　　　C:60
 R  K  H  L  P  G  G  A  S  C  N  N  T  E  I  D  S  G  Y  K 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3700
ACTGCACCTGTAGTACATATAAAAGGTGAAGCAAACAGACTAAAGTGTTTAAGGTATCGG　　　　　C:60
 T  A  P  V  V  H  I  K  G  E  A  N  R  L  K  C  L  R  Y  R 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3760
TTTCAAAAACATAAACAACTGTTTGTTACTGTATCATCCACCTATCATTGGACAAATGTA　　　　　C:60
 F  Q  K  H  K  Q  L  F  V  T  V  S  S  T  Y  H  W  T  N  V 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3820
AACTGTGCTGTAAATAATAGTTATATTACTGTTGTATATAAAGATGAAACCCAACGCCAA　　　　　C:60
 N  C  A  V  N  N  S  Y  I  T  V  V  Y  K  D  E  T  Q  R  Q 　　　　　P:20


         .         .         .         .         .         .　　　　　G:3880
AAATTTTTGGATATTGTAAAAATACCCCCTAGTGTATCACTGGTACTGGGACATATGACA　　　　　C:60
 K  F  L  D  I  V  K  I  P  P  S  V  S  L  V  L  G  H  M  T 　　　　　P:20


         .                                                  　　　　　G:3895
TGTGTTGATATGTAA                                             　　　　　C:15
 C  V  D  M                                                 　　　　　P:4
DETAIL

EPITOPE & MUTATION
